Genetic diversity in pea (Pisum sativum L.) accessions detected by sequence tagged microsatellites markers
2005
Haghnazari, A. (Zanjan Univ. (Iran). Dept. of Agronomy and Plant Breeding) | Samimifard, R. (Agricultural Biotechnology Institute, Zanjan (Iran)) | Najafi, J. (Agricultural Biotechnology Institute, Zanjan (Iran)) | Mardi, M. (Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Raraj)
English. The development of cultivated species and the breeding of new varieties have always relied on the availability of biological diversity, originating from the long term evolution of species. To discover the diversity of pea (Pisum sativum L.) accessions, a collection of 61 pea genotypes (from Germany, Russia, Poland and Iran) was assayed using primers amplifying ten different microsatellite loci. Amongst the 50 alleles identified in the whole collection, nine alleles were observed in the PSBLOX13.1 locus. However, the highest amount of genetic diversity (0.85) was revealed at PEACPLHPPS locus. The evaluated polymorphism information content, probability of identity, genetic diversity and number of alleles indicated that SSR loci, mostly with AT dinucleotide motifs, are powerful tools for assessing genetic diversity. Cluster analysis located the three European collections from Germany, Russia and Poland in one group and the collection from Iran in a separate group. Analysis of molecular variance revealed a non-significant inter-collection variance component (5.15%), compared with intra-collection variance component (94.85%). Principal coordinate analysis confirmed the results obtained from cluster analysis
Show more [+] Less [-]Italian. [Lo sviluppo delle specie coltivate e l'ottenimento di nuove varietà si è basato sempre sulla disponibilità di diversità biologica, originatasi dall'evoluzione a lungo termine delle specie. Per accertare la diversità di accessioni di pisello (Pisum sativum L.), è stata studiata una collezione di 61 genotipi di pisello (provenienti da Germania, Russia, Polonia e Iran) utilizzando primer che amplificavano dieci loci microsatelliti diversi. Nell'ambito dei 50 alleli identificati nell'intera collezione, nove alleli sono stati osservati nel locus PSBLOX13.1. Tuttavia, il livello maggiore di diversità genetica (0,85) è stato osservato al locus PEACLHPPS. Il contenuto informativo del polimorfismo, la probabilità di identità, la diversità genetica e il numero di alleli valutati indicavano che i loci SSR, soprattutto con motif dinucleotidici AT, sono strumenti efficaci per la valutazione della diversità genetica. L'analisi cluster ha collocato le tre collezioni europee da Germania, Russia e Polonia in un unico gruppo, mentre la collezione iraniana è stata inserita in un gruppo separato. L'analisi della varianza molecolare ha evidenziato una componente della varianza inter-collezione non significativa (5,15%), rispetto alla componente intra-collezione (94,85). L'analisi delle coordinate principali ha confermato i risultati ottenuti dall'analisi cluster.]
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Bibliographic information
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