Temporal trends in SSR allele frequencies associated with long-term selection for yield of maize [Zea mays L.; USA; Simple Sequence Repeats]
2006
Feng, L. | Sebastian, S. | Smith, S. | Cooper, M.
English. In association with improved grain yield and agronomic performance of maize hybrids developed by Pioneer Hi-Bred for the central US Corn Belt, there have been detectable changes in the organization of genetic diversity. Genetic diversity was measured using 1,698 Simple Sequence Repeat (SSR) markers distributed over the 10 chromosomes of maize. A subset comprising of 361 SSRs was used to assay the 88 inbred parents of a sequence of 53 successful maize hybrids released by Pioneer Hi-Bred from 1934 to 2004. Patterns of change in SSR allele frequencies over the history of the breeding program are complex and indicative of a large open breeding system. Many of the temporal trends for individual SSR alleles over the history of the breeding program are unique and likely result from the combined influences of many factors that operated during the history of the breeding program. Both random sampling of alleles and selection within the pedigree relationships of the germplasm, from the founding ancestors to the modern inbreds, can explain some of the trends in genetic diversity. In addition, new germplasm with unique genetic diversity was introduced into the breeding effort at different times. Selection has been applied to organize the germplasm into heterotic groups with unique allele combinations at the SSR loci and to increase the frequencies of some alleles within the heterotic groups. The modern commercial maize hybrids of today combine the diversity between the heterotic groups and enable the deployment of this diversity within the US Corn Belt
Show more [+] Less [-]Italian. [In contemporanea al miglioramento della resa in granella del mais e della performance agronomica degli ibridi di mais sviluppati dalla Pioneer Hi-Bred per il Corn Belt centrale degli USA, si sono verificati sensibili cambiamenti nell'organizzazione della diversità genetica. E' stata misurata la diversità genetica utilizzando 1.698 marcatori SSR (Simple Sequence Repeats, sequenze semplici ripetute) distribuiti sui 10 cromosomi del mais. E' stato utilizzato un sottogruppo comprendente 361 SSR per studiare gli 88 parentali consanguinei di una sequenza di 53 ibridi di mais di successo diffusi dalla Pioneer Hi-Bred dal 1934 al 2004. I tipi di cambiamento delle frequenze alleliche SSR nel corso della storia del programma di miglioramento genetico sono complessi e indicativi di un sistema di miglioramento aperto di grande respiro. Molte delle tendenze temporali dei singoli alleli SSR sono uniche e probabilmente sono la conseguenza delle influenze combinate di molti fattori intervenuti nei programmi di miglioramento. Sia la campionatura casuale degli alleli, sia la selezione nell'ambito delle relazioni genealogiche del germoplasma, dai progenitori fondatori alle linee consanguinee moderne, possono spiegare alcune delle tendenze nella diversità genetica. Inoltre, a tempi diversi è stato introdotto nuovo germoplasma con una particolare diversità genetica. E' stata applicata la selezione per organizzare il germoplasma in gruppi di eterosi con combinazioni alleliche uniche ai loci SSR e per aumentare la frequenza di alcuni alleli nell'ambito dei gruppi di eterosi. Gli ibridi commerciali moderni di mais di oggi combinano la diversità fra i gruppi di eterosi e consentono la manifestazione di questa diversità nell'ambito del Corn Belt degli USA.]
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