Studies on pectolytic Erwinia spp. in Portugal reveal unusual strains of Erwinia carotovora subsp. atroseptica [vegetable crops; ornamental plants]
2006
Costa, A.B. | Eloy, M. | Cruz, L. | Janse, J.D. | Oliveira, H.
English. The bacterial pathogens Erwinia carotovora subsp. atroseptica, E. carotovora subsp. carotovora and E. chrysanthemi are responsible for soft rot diseases, affecting plants in the field and/or in storage. Thirty-one strains from Portugal and elsewhere were characterised by classical, fatty acid methyl ester (FAME) and molecular methods (MSP-PCR and BOX-PCR). Ten strains were identified as E. carotovora subsp. atroseptica, 10 as E. carotovora subsp. carotovora, and 11 as E. chrysanthemi by classical methods. Strains of E.c. subsp. carotovora and E. chrysanthemi were phenotypically, chemotaxonomically, and genetically highly variable. E. c. subsp. atroseptica strains isolated from Portuguese fields had low molecular variability, but FAME analysis revealed high phenotypic variability. Fatty acid profiles of the Portuguese strains were compared with 27 E. c. subsp. atroseptica profiles obtained from the Dutch Plant Protection Service (PD) collection. The Portuguese E. c. subsp. atroseptica strains clustered separately from PD E. c. subsp. atroseptica strains. However, the clusters are not distant enough for Portuguese strains to be included in separate subspecies. Therefore, these Portuguese E. carotovora subsp. atroseptica strains may constitute an ecotype occurring in Portugal
Show more [+] Less [-]Italian. [I batteri patogeni Erwinia carotovora subsp. atroseptica, E. carotovora subsp. carotovora ed E. chrysanthemi sono responsabili delle malattie indicate come marciume molle, che interessano le piante in campo e/o nel corso della conservazione. Trentanove ceppi provenienti dal Portogallo e da altre parti sono stati caratterizzati mediante metodi classici, degli esteri metilici degli acidi grassi (FAME) e molecolari (MSP-PCR e BOX-PCR). Dieci ceppi sono stati identificati come appartenenti a E. carotovora subsp. atroseptica, 10 a E. c. subsp. carotovora e 11 a E. chrysanthemi, mediante metodi classici. I ceppi di E. c. subsp. carotovora e di E. chrysanthemi erano altamente variabili dal punto di vista fenotipico, chemiotassonomico e genetico. I ceppi di E. c. subsp. atroseptica isolati dai campi portoghesi presentavano una bassa variabilità molecolare, ma l'analisi FAME ha evidenziato un'elevata variabilità fenotipica. I profili degli acidi grassi dei ceppi portoghesi sono stati confrontati con 27 profili di E. c. subsp. atroseptica ottenuti dalla collezione del Servizio Olandese di Protezione delle Piante (PD). I ceppi portoghesi di E. c. subsp. atroseptica si raggruppavano separatamente dai ceppi di E. c. subsp. atroseptica del PD. Tuttavia, i cluster non sono sufficientemente distanti da includere i ceppi portoghesi in una sottospecie separata. Perciò, questi ceppi portoghesi di E. carotovora subsp. atroseptica possono essere considerati come costituenti un ecotipo presente in Portogallo.]
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