The allele pool characteristics of sheep breeds in the south of Russia | Характеристика аллелофонда овец юга России

English. Using 11 microsatellite markers (HSC, OarAE119, OarCP49, OarFCB11, MAF214, MCM42, TGLA53, MAF65, McM527, INRA49, OarFCB20) as the instrument for the allele pool analysis the population genetic description of 3 fine-wool sheep breeds in the South of Russia (Stavropolskaya, Groznenskaya, Soviet Merinos) was done. The studied sheep breeds had a high degree of genetic diversity. The average number of alleles per a microsatellite locus was 10.4-12.3 with the average number of effective alleles per a locus varied from 5.4 alleles for Groznenskaya breed to 7.7 ones for Stavropolskaya breed. Seventy six private alleles were identified for all breeds, including 36 alleles for Stavropolskaya breed, 17 alleles for Groznenskaya breed and 23 alleles for Soviet Merinos. 5 breed specific private alleles were identified including 4 alleles for Stavropolskaya breed (122 loci Oar FCB11, 225 loci MAF214, 138 and 149 loci TGLA53) and one allele for Soviet Merinos (87 loci OarСР49). The observed heterozygote degree was varied from 0.510±0.041 in Stavropolskaya breed to 0.678±0.035 in Soviet Merinos. The different contribution of loci into heterozygote degree was observed which varied from 0.281 for HSC loci to 0.967 for TGLA53 loci. The heterozygote deficiency and positive Fis fixation index - from 0.148 to 0.401 were observed in all analyzed breeds. The calculation of Fst fixation index showed that 95.7% of diversity was due to in-bred differences and only 4.3% was due to differences between breeds. The consolidation of studied sheep breeds was 100%. The structure of phylogenetic tree was in accordance with the historical aspects of breeds' origins.

Russian. С использованием 11 микросателлитных маркеров (HSC, OarAE119, OarCP49, OarFCB11, MAF214, MCM42, TGLA53, MAF65, McM527, INRA49, OarFCB20) в качестве инструмента анализа аллелофонда дана популяционно-генетическая характеристика 3 тонкорунных пород овец юга России (ставропольская, грозненская, советский меринос). Исследуемые породы характеризуются высоким уровнем генетического разнообразия. Среднее число аллелей на локус микросателлитов составляет 10,4-12,3; при этом эффективное число аллелей на локус варьирует в зависимости от породы от 5,4 в грозненской до 7,7 в ставропольской. Идентифицировано 76 приватных аллелей, в том числе 36 в ставропольской породе, 17 – в грозненской и 23 – в породе советский меринос. Выявлено 5 породоспецифичных приватных аллелей: 4 в ставропольской породе – 122 локуса Oar FCB11, 225 локуса MAF214, 138 и 149 локуса TGLA53 и один в породе советский меринос – 87 локуса OarСР49. Наблюдаемая степень гетерозиготности варьировала от 0,510±0,041 в ставропольской породе до 0,678±0,035 в породе советский меринос. Установлен различный вклад отдельных локусов в степень гетерозиготности, которая варьировала от 0,281 в локусе HSC до 0,967 в локусе TGLA53. Во всех исследованных популяциях отмечен дефицит гетерозигот и положительный индекс фиксации Fis – от 0,148 до 0,401. На основе значений индекса фиксации Fst показано, что 95,7% всего разнообразия обусловлено внутрипородными различиями и только 4,3% приходится на межпородные. Выявлена 100,0%-ная степень консолидированности изучаемых пород овец. Структура генетического дерева согласуется с историческими аспектами создания пород.