Étude in silico, in vitro et in vivo de la virulence de souches de Mycobacterium bovis à l’origine de foyers de tuberculose bovine.

French. Mycobacterium bovis est une bactérie zoonotique du complexe de M. tuberculosis (MTBC), endémique dans de nombreux pays, principal responsable de la tuberculose chez les bovins (bTB). A l’inverse, M. tuberculosis est à l’origine de tuberculose humaine mais rarement bovine. Un programme national d’assainissement puis d’éradication (fin des années 50) a permis à la France d’être reconnue officiellement indemne de bTB en 2000 (prévalence cheptel annuelle < 0,1%). Cependant depuis 5 ans, on observe une recrudescence de la bTB qui met en péril le statut de la France : la perte du statut indemne mènerait à d’importantes pertes économiques pour les éleveurs et l’industrie agroalimentaire, notamment par l’impossibilité des échanges commerciaux. Pour mieux comprendre la dynamique de la maladie, et afin de réaliser un suivi épidémiologique plus précis des foyers et des liens entre foyers dans l’espace et dans le temps, nous avons réalisé le génotypage de la souchothèque de M. bovis du Laboratoire National de Référence-Anses (2500 isolats, 1978-2011) par deux méthodes : le spoligotypage et le MLVA. Ce couplage permet une identification précise de souches pour comprendre les schémas d’évolution et de dissémination de la bactérie. Dans cette étude nous avons sélectionné les types de souches françaises de M. bovis les plus représentatives dans l’histoire de la bTB (souches anciennes disparues, endémiques depuis plusieurs années, et d’émergence locale). Nous réaliserons une caractérisation de SNPs sur de putatifs gènes de virulence qui pourraient être à l’origine de différents profils de pathogénicité-transmissibilité. Ces données devraient nous permettre de comprendre si l’émergence actuelle de la maladie résulte d’une augmentation de la virulence ou de facteurs humains (techniques/ type d’élevage).