Sélection sur gènes et sélection assistée par marqueurs

French. Jusqu’à une date très récente (l’émergence de la sélection génomique), l’essentiel des plans de sélection était basé sur l’évaluation des valeurs génétiques à partir des informations phénotypiques et de pedigree. Cependant, ont aussi été mis en place plusieurs exemples réussis de sélection valorisant la connaissance de gènes à effets importants sur les caractères ou utilisant l’aide de marqueurs moléculaires(la «Sélection Assistée par Marqueurs»). Ces exemples sont riches en enseignements pour l’avenir de la sélection. Les applications furent variées, tant en termes de type de caractères (reproduction, qualité de carcasse, résistance aux maladies...) que d’organisation(éliminations d’allèles défavorables, introgression, accouplements ciblés…). Les limites, qui sont détaillées, de ces plans de sélection sur gènes ou marqueurs, sont autant de contraintes qu’il faudra intégrer dans l’organisation de la sélection génomique.

English. Until recently (when genomic selection started at a large scale), most of the selection plans were based on breeding value estimations from phenotypic and pedigree information. Nevertheless, a number of successful breeding schemes were also organized, using information on genes displaying large effects on the traits or using genomic markers ("Marker Assisted Selection"). These examples carry useful information about the future of selection. Realizations were polymorphic, both in terms of traits (reproduction, carcass quality, disease resistance...) and organization (counter selection of unfavorable alleles, between breeds introgression, mate selection...). Limits of these schemes, which are detailed in this paper, are constraints which will have to be considered in the future genomic selection organization.