Genetic variability within french race and riding horse breeds from genealogical data and blood marker polymorphisms

French. On a dressé un bilan de la variabilité génétique au sein des cinq principales races françaises de chevaux de course et de sport, le Pur-Sang, le Trotteur Français, l’Arabe, l’Anglo-Arabe et le Selle Français. On a utilisé les données généalogiques ainsi que les résultats de typage pour sept groupes sanguins et neuf protéines sanguines. La distribution du nombre de descendants, mâles ou femelles, par étalon est déséquilibrée, particulièrement pour le Trotteur Français, le Selle Français et le Pur-Sang. Le coefficient de consanguinité moyen des animaux nés entre 1989 et 1992 est de 1, 02 % (Pur-Sang), 1,86 %, (Trotteur Français), 3,08 % (Arabe), 1,17 % (Anglo-Arabe) et 0,70 % (Selle Français). Des coefficients individuels élevés (> 6,25 %) n’ont été trouvés en proportion substantielle que chez l’Arabe, où ils représentent un cinquième des valeurs calculées. Une analyse des coefficients moyens en fonction du nombre de générations d’ancêtres considéré montre l’importance de la consanguinité éloignée chez le Pur-Sang et de la consanguinité proche chez l’Arabe, seule race où la pratique des accouplements entre proches apparentés semble être courante. De 1974 à 1992, le taux d’accroissement du coefficient de consanguinité moyen (en points de pourcentage) par année de naissance a été de + 0, 026 (Pur-Sang), + 0, 052 (Trotteur Français), + 0, 071 (Arabe), + 0, 029 (Anglo-Arabe) and + 0, 024 (Selle Français). La distribution des contributions des ancêtres fondateurs au patrimoine génétique actuel est déséquilibrée. La situation est particulièrement critique chez le Trotteur Français, où seulement 25 animaux fondateurs contribuent pour la moitié des gènes présents actuellement. Aucune tendance significative d’évolution des fréquences géniques des marqueurs sanguins n’a pu être mise en évidence. L’hétérozygotie moyenne est la plus élevée pour le Trotteur Français et le Selle Français et la plus faible pour le Pur-Sang et l’Anglo-Arabe. La signification et les causes de l’évolution récente de la variabilité génétique au sein de chaque race sont discutées. On insiste sur la nécessité de mieux équilibrer les tailles de familles paternelles afin de préserver la variabilité actuelle.

English. The genetic variability of five horse breeds raised in France was analysed: Thoroughbred, Trotteur Français, Arab, Anglo-Arab and Selle Français. Genealogical data and genotypes at seven blood group and nine protein loci were used. Paternal family sizes were found to be unbalanced, especially in Trotteur français, Selle Franqais and Thoroughbred. Average coefficients of inbreeding for offspring born from 1989 to 1992 were 1.02 (Thoroughbred), 1.86 (Trotteur Français), 3.08 (Arab), 1.17 (Anglo-Arab) and 0.70% (Selle Français). High individual coefficients (> 6.25%) were found in substantial proportions only in Arab, where such high values represent one fifth of the total individual coefficients. Inbreeding was analysed according to the number of generations of ancestors considered. The results revealed the importance of close inbreeding in Arab and remote inbreeding in Thoroughbred. Arab was the only breed that showed evidence for a substantial amount of mating between close relatives. From 1974 to 1992, the rates of inbreeding, in percentage points per year, were + 0.026 (Thoroughbred), + 0.052 (Trotteur Français), + 0.071 (Arab), + 0.029 (Anglo-Arab) and + 0.024 (Selle Franqais). The distribution of genetic contributions of founder animals was found to be unbalanced, especially in Trotteur Français where 25 founder animals only accounted for half the actual gene pool. No significant time-trend was found for blood markers allelic frequencies. The mean heterozygosity was highest in Trotteur Franqais and Selle Français and lowest in Thoroughbred and Anglo-Arab. The meaning of recent trends for genetic variability is discussed. The need for equalizing paternal family sizes in the future is outlined.