Baltā āboliņa (Trifolium Repens L.) ģenētiskā daudzveidība Rīgas pilsētvidē | Genetic diversity of white clover (Trifolium Repens L.) from the urban area of Rīga

English. White clover (Trifolium repens L.) is well represented in the urban environment and wide areas. The goal of this study was to compare the genetic features and to determine the genetic distances and similarities between some populations of white clover using iPBS (inter primer binding sites) technique in a retrotransposon-based method in samples from ecologically different areas in Latvia. Comparisons were made between three plant groups: urban environment (different areas in Rīga), Latvian countryside territory (four different localities), and the commercial variety ‘Daile’. The Shannon diversity index was not high (0.2974 for Rīga, 0.3079 in countryside territories, and 0.3367 for the variety ‘Daile’), but the polymorphic bands present in all evaluated plant sets were higher than 89%. Using principal coordinates analysis the white clover formed three clusters. One cluster included plants from the variety ‘Daile’. The plants from Rīga urban area and different sites of Latvia formed two clusters.

Latvian. Baltais āboliņš (Trifolium repens L.) ir tauriņziežu dzimtas augs, plaši izplatīts gan pilsētvidē, gan ārpus tās. Tas tiek izmantots kā lauksaimniecības augs biomasas iegūšanai, un tā ir arī populāra daudzgadīgos zālienus veidojošā suga - pilsētvidē balto āboliņu sēj zālājos. Baltais āboliņš plaši pārstāvēts dažādos biotopos ar mainīgu ārējo faktoru ietekmi, tai skaitā pilsētvidē. Tādēļ tas ir piemērots modeļobjekts antropogēnās ietekmes pētīšanai. Darba mērķis bija noteikt baltā āboliņa Latvijas populācijas ģenētisko daudzveidību, izmantojot iPBS (inter primer binding sites) - uz retrotranspazoniem balstītu metodi. Iegūtie rezultāti salīdzināti starp trim augu paraugkopām: pilsētvidē augoši augi (Rīgas pilsētas teritorija), dabiskā vide (Latvijas novadu teritorijas) un selekcionētā šķirne 'Daile'. Lai gan polimorfo lokusu skaits visās pētītajās grupās bija augsts (89%), tomēr Šanona (Shannon) indekss, kas raksturo grupu iekšējo ģenētisko daudzveidību, pētāmajām grupām svārstījās tikai ap 0.3. Šāds rezultāts norāda uz to, ka iekšējo grupu polimorfismu nosaka neliels ģenētiski atšķirīgu augu skaits. Galveno koordināšu analīzē, kas balstīta uz Šanona indeksu, visi pētītie paraugi izveidoja trīs grupas. Vienā no tiem grupējās šķirnes 'Daile' augi, savukārt baltais āboliņš no pilsētvides un Latvijas reģioniem izveidoja divas atšķirīgas grupas.