Degree estimation of polymorphism of SSR markers for varietal identification of Persian walnut | Оценка степени полиморфизма SSR-маркеров для сортовой идентификации ореха грецкого

English. Polymorphism of 11 varieties and pre-selection forms of walnut (Juglans regia) by two microsatellite loci was analyzed. Studied varieties and forms of walnut are adapted to the agro-climatic conditions of the North Caucasus and Kuban region and they are of breeding interest as sources of traits of high economic value. Primer pairs WGA069 and WGA202 obtained during the sequencing of the genome of black walnut were used for the analysis. The length range of PCR products of these markers do not overlap, which allowed them to be grouped in a multiplex set. It was revealed in studied varieties set five alleles by WGA069 (fragment length of 164, 166, 174, 180 base pairs, and zero-allele) and four alleles by WGA202 (253, 263, 265 и 269 base pairs). Individual SSR-profiles with unique set of alleles for all studied varieties were composed. Prospects of WGA069 and WGA202 SSR-markers for walnut varieties identification is proved.

Russian. Проведен анализ полиморфизма по 2 микросателлитным локусам 11-ти сортов и форм ореха грецкого, адаптированных к агроклиматическим условиям Северного Кавказа и Кубани и представляющих селекционный интерес как источники хозяйственно ценных признаков. Для анализа были использованы SSR-маркеры WGA069 и WGA202, сгруппированные в мультиплексный набор, т.к. диапазоны длин ПЦР-продуктов этих маркеров не перекрываются. В исследованной выборке сортов по локусу WGA069 было выявлено 5 аллелей (длины фрагментов 164, 166, 174, 180 п.н. и нуль-аллель), по локусу WGA202 – 4 аллеля (253, 263, 265 и 269 п.н.). Составлены индивидуальные SSR-профили, обладающие уникальным набором аллелей, для каждого из изученных сортов. Подтверждена перспективность использования SSR-маркеров WGA069 и WGA202 при идентификации сортов ореха грецкого.