Epidemiological features and molecular-genetic characterization of rabies virus isolates at the republic Tatarstan | Особенности эпизоотического процесса и молекулярно-генетических характеристик изолятов вируса бешенства в республике Татарстан

English. The epizootic situation on rabies in the Republic of Tatarstan based on data of 2013-2014 is considered. Using the methods of molecular epizootology the species and number content of the animals with the laboratory-based confirmed infection was analyzed, and phylogenetic analyses of the rabies agents isolated in various regions of the republic was done. The sickness rate, coefficient of focality, and infection rate were calculated. These parameters were rather high, thus confirming the epidemic situation on rabies in Tatarstan. The G gene fragment of rabies field isolates from Tatarstan was sequenced and compared with similar fragment from reference strains. A comparative analysis showed no genomic differences in nucleotide and amino acid sequences between the field isolates. The difference in nucleotide sequence between field and reference strains was as high as 8%, while in their amino acid sequences no difference was found. This suggests high selective pressure on the amino acid structure of the analyzed fragments. Since live vaccines are widely used to control rabies in wild animals, it is necessary to check potential reversion of vaccine strains to the virulent one. In the enzootic area of Tatarstan rabies was determined to be eventual and natural focal infection. Nozoologic maps were developed in a computed geo-informational system and the vector of epidemic process in the Republic of Tatarstan within 2013-2014 was determined.

Russian. Рассмотрена эпизоотическая ситуация по бешенству в Республике Татарстан по данным за 2013-2014 гг. Методами молекулярной эпизоотологии проанализирован видовой и количественный состав животных с лабораторно подтвержденным заболеванием и проведен филогенетический анализ изолятов возбудителя из различных районов республики. Рассчитаны показатели: индекс заболеваемости, коэффициент очаговости и индекс неблагополучия. Они оказались достаточно высокими, что подтверждает факт неблагополучия Республики Татарстан по бешенству. Определена нуклеотидная последовательность фрагмента гена G полевых изолятов вируса бешенства из Республики Татарстан. При сравнении нуклеотидных и аминокислотных последовательностей исследуемых изолятов между собой практически не выявлено геномных отличий. При сравнении исследуемых проб с референтными штаммами было выявлено около 8% отличий в последовательности нуклеотидов, но при сравнении последовательностей аминокислот отличий не выявлено, что показывает селективное давление на структуру аминокислот, кодируемую в данном фрагменте. Так как главную роль в борьбе с бешенством играют регулирование численности и оральная иммунизация диких животных живой вакциной, возможна реверсия вакцинного штамма к вирулентному. Сделан вывод, что на территории Республики Татарстан бешенство является эвентуальным природно-очаговым заболеванием. В геоинформационной системе были созданы нозологические карты и определен вектор продвижения эпизоотии по территории республики в 2013-2014 гг.