Применение ДНК-маркеров при оценке генофонда ясеня обыкновенного в городских насаждениях г.Уфы | Application of DNA-markers at the assessment of the gene pool of the fraxinus excelsior in city plantings of Ufa

Russian. Объектом исследования являлся ясень обыкновенный (Fraxinus excelsior L.) - декоративный древесный вид, устойчивый к промышленным загрязнениям и вследствие этого широкой используемый в России для озеленения городов. Для анализа полиморфизма ДНК провели отбор листьев с 10 деревьев ясеня, произрастающих в г. Уфа. ДНК анализ предусматривал 4 этапа: выделение ДНК, амплификация (ПЦР), электрофорез, фотодокументирование. Отобраны 2 ISSR-праймера, полимеразная цепная реакция с которыми дает высоковариабельные и стабильные электрофоретические профили. В изученной популяции выявлен 21 амплифицированный ISSR-фрагмент, из которых 14 были полиморфными. Основные параметры генетической изменчивости изученной популяции: среднее число аллей на локус – 1,714, доля полиморфных локусов – 66,35%, уровень ожидаемой гетерозиготности – 0,201. Данные показатели указывают на то, что генофонд интродуцированной уфимской популяции недостаточно богат. Для создания устойчивых и высокопродуктивных насаждений необходимо разнообразить спектр происхождения семян или посадочного материала. Разработанная технология ДНК-анализа с использованием ISSR-маркеров может быть рекомендована для дальнейшего мониторинга состояния генофонда ясеня обыкновенного и других древесных видов.

English. Common ash (Fraxinus excelsior L.) was used for study. It is decorative wood species, resistant to industrial pollution and thereof used in Russia widely for municipal forestry. Leaves were sampled from 10 ash trees, growing in Ufa, to analyze DNA polymorphism. DNA analysis involved 4 stages: DNA isolation, amplification (PCR), electrophoresis, photographic documentation. 2 ISSR-primers were selected, polymerase chain reaction with which gives highly variable and stable electrophoretic profiles. 21 amplificated ISSR fragments, 14 of which were polymorphic, are found in studied species. Main parameters of genetic variability of studied species are: the average number of alleys for the locus - 1.714, the proportion of polymorphic loci - 66.35%, the level of expected heterozygosity - 0.201. These figures indicate insufficient genetic pool of introduced species in Ufa. To create stable and highly productive plants it is necessary to diversify the origin of seeds or planting material. The developed technology of DNA analysis using ISSR markers can be recommended for further monitoring of gene pool of common ash and other tree species.