Genetic heterogeneity of sires of the Yaroslavl breed by DNA markers | Генетическая гетерогенность быков-производителей ярославской породы по маркерам ДНК

English. Analysis of polymorphism of 11 STR loci TGLA53, TGLA126, TGLA122, TGLA227, ETH3, ETH10, ETH225, BM1824, BM2113, SPS115, INRA23 in purebred sires of the Yaroslavl breed is presented. An average of 7.4 alleles per locus with a frequency of 0.01-0.71 had been identified. Locus SPS115 were characterized by the lowest number of alleles (4 alleles), and the loci TGLA122, TGLA227, BM2113 and TGLA53 - the highest number of alleles (10 alleles).The number of informative alleles whose frequency exceeds 5%, ranged in the studied loci from 3 to 6 and the average was 4.5 alleles at the locus. The maximum number of effective alleles recorded in the loci ETH225-5.2; BM2113-5.0; TGLA227-4.9 and TGLA122-4.8. In purebred bulls of the Yaroslavl breed 6 private genetic variants has been identified at the loci ETH225, BM2113, TGLA53, TGLA122 and TGLA227 with a frequency of from 0.01 to 0.3. The value of the expected level of heterozygosity ranged from 0.453 (locus SPS115) to 0.809 (locus ETH225), while observed heterozygosity ranged from 0.480 (locus SPS115) to 0.900 (TGLA122). The mean value of observed heterozygosity (0.727) was slightly higher than the expected value (0.715). The polymorphism information content (PIC) values were on average of 0.677. In 10 studied STR loci the PIC value is greater than 0.5. The maximum value of the polymorphism information content was observed in the locus ETH225-0.781. High PIC values were observed at the loci BM2113-0.775; TGLA227-0.769 and TGLA122-0.767, and the smallest at the SPS115-0.409 and BM1824-0.549. Thus, highly informative microsatellite loci can be used as markers for identification and evaluation of genetic heterogeneity of animals of the Yaroslavl breed.

Russian. Изучен полиморфизм 11-ти STR-локусов: TGLA53, TGLA126, TGLA122, TGLA227, ETH3, ETH10, ETH225, BM1824, BM2113, SPS115, INRA23 у чистопородных быков-производителей ярославской породы. Выявлено в среднем 7,4 аллеля на локус с частотой встречаемости 0,01-0,71. Локус SPS115 характеризовался наименьшим числом генетических вариантов (4 аллеля), а локусы TGLA122, TGLA227, TGLA53 и BM2113 - наибольшим количеством вариантов (по 10 аллелей на локус). Число информативных аллелей, частота которых превышает 5%, варьировало в изученных локусах от 3-х до 6-ти и в среднем составило 4,5 аллеля на локус. Максимальное количество эффективных аллелей зафиксировано в локусах ETH225 - 5,2; BM2113 - 5,0; TGLA227 - 4,9 и TGLA122 - 4,8. У чистопородных быков ярославской породы выявлено 6 приватных генетических вариантов в локусах ETH225, BM2113, TGLA53, TGLA122 и TGLA227 с частотой встречаемости от 0,01 до 0,3. Значение ожидаемого уровня гетерозиготности варьировало от 0,453 у SPS115 до 0,809 у ETH225, в то время как наблюдаемая гетерозиготность варьировала от 0,480 у SPS115 до 0,900 у TGLA122. Среднее значение наблюдаемой гетерозиготности - 0,727 - несколько превысило ожидаемое значение - 0,715. Показатель информативной ценности в среднем достиг 0,677, в 10 из 11 изученных STR-локусов значение PIC больше 0,5. Максимальная величина показателя информативной ценности отмечена у локуса ETH225 - 0,781. Высокие значения информативной ценности наблюдались у локусов BM2113 - 0,775; TGLA227 - 0,769 и TGLA122 - 0,767, а наименьшие у SPS115 - 0,409 и BM1824 - 0,549. Таким образом, высокая информативность микросателлитных локусов позволяет их использовать в качестве маркеров для идентификации и оценки генетической гетерогенности животных ярославской породы.