Polymorphism of microsatellite loci OarCP549, CSRD247, FCB20 and MAF65 in sheep | Полиморфизм микросателлитных локусов OarCP549, CSRD247, FCB20 и MAF65 у овец

English. The Salsk breed of sheep is created as a result of many years work of breeders in the Rostov region. Studies of its genetic diversity are necessary for their conservation, further improvement and use of the breed. The aim of the work was to study polymorphism of microsatellite loci OarCP549, CSRD247, FCB20, and MAF65 in sheep of Salsk breed. Tissue samples were collected in sheep kept at one of the breeding farms in the Rostov Region). Analysis of microsatellites was performed nu a 16-capillary ABI3130xl Genetic Analyzer. To estimate polymorphism of loci it was taken into account: the Number of Alleles per locus (NA); Observed (Ho) and the Expected (He) Heterozygosity, the Effective Number of Alleles per locus (Ae). The highest Number of Alleles (NA = 17) and the Effective Number of Alleles (Ae = 7) was determined from the locus OarCP49 in the sheep of the Salsk breed. At other loci, the Number of Alleles was 15, 12 and 9, and the Effective Number of Alleles was 5.56, 5.33 and 3.85 respectively for CSRD247, FCB20 and MAF65. The heterozygote deficiency in the population is noted at the loci CSRD247 and MAF65. Average index of fixation for four loci was 0.094. There was detected polymorphism of microsatellite loci OarCP49, CSRD247, FCB20 and MAF65 and grounded the expediency of their inclusion in the panel of DNA markers for assessing the genetic diversity and authenticity of the origin for the sheep of Salsk breed.

Russian. В результате многолетней работы селекционеров Ростовской обл. была создана сальская порода овец. Исследование ее генетического разнообразия необходимо для сохранения, дальнейшего совершенствования и использования породы. Цель работы - изучить полиморфизм микросателлитных локусов OarCP549, CSRD247, FCB20 и MAF65 у овец сальской породы. Образцы тканей были взяты у 95 овец, содержащихся на одном из племзаводов в Ростовской обл. Анализ микросателлитов выполняли на 16-капиллярном генетическом анализаторе АВI3130xl Genetic Analyzer. Для оценки полиморфизма локусов учитывали количество аллелей на локус (NА); наблюдаемую (Но) и ожидаемую (Не) гетерозиготность, эффективное число аллелей на локус (Ае). Связь между индивидуальными особями и популяцией в целом определяли на основе индекса фиксации (Fis). Наибольшее количество аллелей (NA=17) и эффективное число аллелей (Ae = 7) у изучаемого поголовья овец было определено по локусу OarCP49. По другим локусам количество аллелей составило 15, 12 и 9, эффективное число аллелей 5,56; 5,33 и 3,85 соответственно для CSRD247, FCB20 и MAF65. Дефицит гетерозигот в популяции отмечен по локусам CSRD247 и MAF65. В среднем по четырем локусам индекс фиксации составил 0,094. Выявлено наличие полиморфизма микросателлитных локусов OarCP49, CSRD247, FCB20 и MAF65, обоснована целесообразность их включения в панель ДНК-маркеров для оценки генетического разнообразия и достоверности происхождения овец сальской породы.