INVESTIGATION OF THE ASSOCIATIONS OF SCD GENE POLYMORPHISM WITH INTRAMUSCULAR FAT CONTENT IN DUROC AND LARGE WHITE PIG BREEDS | Исследование ассоциаций полиморфизма гена SCD с содержанием внутримышечного жира у свиней пород дюрок и крупная белая

English. A scientific novelty is the study of the allele pool of domestic reproduction pigs, the determination of population genetic parameters by DNA markers, and the search for associations of genetic variants with economically significant traits. The aim of the work was to study the influence of SCD Y487830 polymorphism: g.2228 T C to the IMF content and to search for associations of genotypes with economically significant traits in domestic reproduction pigs. The studies were conducted in 2019 on pigs reared in Selection and Hybrid Center LLC (Voronezh region). Genotyping were determined by the QuantStudio 5 Real-Time PCR System using the developed test system. The content of IMF (%), backfat thickness (mm), lean (%), live weight (kg) in 103 boars and 27 gilts Duroc pigs, 30 Large White boars was determined using an ExaGo ultrasound scan- ner. The main diet and animal welfare conditions were identical and corresponded to zoosanitary standards. Model equation for multivariate analysis of variance with interaction was used to evaluate the effect of genotype by SCD on productive qualities. The frequency of the T allele and TT genotype in the group of Duroc pigs was 0.419 and 12.7%, respectively. Large White pig breeds were characterized by the frequency of the T allele - 0.686, TT genotype - 46.8%. All Landrace pigs were carriers of the TT genotype. The superiority of the C allele carriers in the content of IMF was shown. The difference between Duroc boars with TT and CC genotypes was 0.42% (P no more 0.05), andindividuals with CC genotype exceeded TT genotype carriers in the backfat thickness of more than 3 mm (P no more 0.001). The results confirm the association of the SCD genotype with the content of intramuscular fat and the backfat thickness in the Duroc boars.

Russian. Научной новизной характеризуются изучение аллелофонда свиней отечественной репродукции, определение популяционно-генетических параметров по ДНК-маркерам, поиск ассоциаций генетических вариантов с экономически-значимыми признаками. Целью работы являлось изучение влияния полиморфизма SCD Y487830: g.2228 T C на содержание внутримышечного жира и поиск ассоциаций генотипов с экономически значимыми признаками у свиней отечественной репродукции. Исследования проводили в 2019 г. на свиньях, разводимых в одном из хозяйств Воронежской области. Генотипы по SCD определяли методом ПЦР-РВ на ДНК-амплификаторе Quant Studio 5 с использованием разработанной тест-системы. Посредством УЗИ-сканера ExaGo определяли содержание ВМЖ (%), толщину шпика (мм), постность (%), живую массу (кг) у 103 хряков и 27 свинок породы дюрок, 30 хряков породы крупная белая. Основной рацион и условия содержания животных были идентичны и соответствовали зоогигиеническим нормам. Для оценки эффекта генотипа по SCD на продуктивные качества использовали уравнение модели для многофакторного дисперсионного анализа с взаимодействием. Частота аллеля T и генотипа ТТ в группе свиней породы дюрок составила 0,419 и 12,7%, соответственно. Свиньи крупной белой породы характеризовались частотой аллеля Т - 0,686, генотипа ТТ - 46,8%. Все ландрасы являлись носителями генотипа TT. Показано превосходство носителей аллеля С по содержанию ВМЖ. Разница между хряками породы дюрок с генотипами ТТ и СС составила 0,42% (Р не более 0,05), а особи с генотипом СС превосходили носителей генотипа ТТ по толщине шпика более чем на 3 мм (Р не более 0,001). Полученные результаты подтверждают наличие ассоциации генотипа по SCD с содержанием внутримышечного жира и толщиной шпика у хряков породы дюрок.