Impact de la capacité nécrogène sur la valeur adaptative du virus Y de la pomme de terre
2008
Rolland, Mathieu
French. Le virus Y de la pomme de terre (PVY, genre Potyvirus), transmis par puceron selon le mode non persistant, est l’un des virus les plus dommageables sur pomme de terre. Décrits pour la première fois dans les années 1930, les isolats «pomme de terre» du PVY ont été principalement répartis au sein de deux groupes sur la base de leur capacité à induire (PVYN) ou non (PVYO) des nécroses foliaires sur tabac (Nicotiana tabacum cv Xanthi) et de leurs propriétés biologiques sur différentes variétés de pomme de terre (Solanum tuberosum). Les travaux d’épidémiologie virale effectués au cours des vingt dernières années indiquent que les isolats PVYN, particulièrement dommageables, se sont progressivement propagés dans les cultures pour occuper aujourd’hui une place prépondérante au sein des populations naturelles de PVY. Sur la base de ce constat, le développement d'outils permettant d'assurer la maitrise de ces isolats est nécessaire. Par ailleurs, les facteurs liés à l'émergence de cette nouvelle problématique agronomique doivent être identifiés afin de mettre en place une stratégie de lutte adaptée. De récents travaux ont permis d'identifier des déterminants moléculaires liés à la capacité nécrogène du PVY (A/G2213 et A/C2271). Ceux-ci ont été utilisés comme cibles pour le développement d'un outil basé sur la technologie SNaPshot. Cet outil innovant assure pour la première fois la caractérisation des isolats de PVY sur la base de leur capacité à induire des nécroses. Les résultats épidémiologiques sont en faveur d’un gain de valeur adaptative lié à la capacité nécrogène des isolats de PVY. Cette hypothèse est également en accord avec la vision de la phylogénie du PVY selon laquelle les isolats non nécrogènes seraient des isolats ancestraux. Des isolats naturels ainsi que trois génotypes mutés aux positions 2213 et/ou 2271, ont été utilisés afin de déterminer l'impact de l’acquisition de la capacité nécrogène sur la valeur adaptative du virus. Cette étude a été conduite en réalisant des inoculations simples, des compétitions entre génotypes viraux, des passages en séries et des transmissions aphidiennes. Les résultats acquis lors de ces expérimentations mettent en évidence une baisse de valeur adaptative associée à l’acquisition de la capacité nécrogène. De plus, le fond génétique viral semble jouer un rôle important dans le processus d’acquisition des déterminants moléculaires décrits pour leur rôle dans l’expression de la capacité nécrogène (A2213 et A2271). Compte tenu de ces données, la phylogénie du PVY et la lutte contre ce virus sont discutés
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