The use of different methods to research the effect of K232A polymorphism of the DGAT1 gene on dairy productivity of cows | Использование разных методов для изучения влияния полиморфизма К232а гена DGAT1 на молочную продуктивность коров

English. The study of genes-markers of quantitative traits is an urgent task. According to numerous scientific works, it is known that the K232A mutation in the DGAT1 gene is associated with signs of milk production in cattle: allele K with a % fat content in milk, and allele A with the amount of milk. In this regard, the development of an optimal method for detecting SNP and allelic polymorphism is of scientific interest. To study the K232A polymorphism, 2 methods of molecular genetic analysis were used in the work: 1) real-time PCR with a system of primers and probes labeled with FAM and R6G fluorochromes; 2) PCR-RFLP with processing of amplification products with restriction endonuclease BglI and detection of samples in 15% polyacrylamide gel using a gel documentation system. The study was carried out in 2 stages, corresponding to two reporting periods on the farm. At the first stage, 200 cows were genotyped using real-time PCR. All animals turned out to be homozygous for allele A. At the second stage, the method of PCR polymorphism of the lengths of restriction fragments was used, with the help of which the genotypes of 102 animals were established - 64 cows with the AA genotype; 34 heads with the AK genotype and 4 heads with the KK genotype. The frequency distribution corresponded to the Hardy-Weinberg equilibrium. Allele frequencies were A - p = 0.79; K- q = 0.21. Criterion x2 is 0.04 (р is less than 0.05). Cows with the AA genotype had significantly high milk yield rates of +341.8 kg, p not more than 0.01; with AK genotype, fat percentage +0.131, p not more than 0.01 in 305 days 1 lactation. Calculation of the Student's criterion when comparing milk yield and fat content for full 1 lactation of cows with different genotypes showed that all the empirical values are in the zone of insignificance.

Russian. Изучение генов-маркеров количественных признаков у с.-х. животных является актуальной задачей. По многочисленным научным работам известно, что мутация К232А в генеDGAT1 ассоциирует с признаками молочной продуктивности у крупного рогатого скота: аллель К – с % содержанием жира в молоке, а аллель А - с количеством молока. В связи с этим разработка оптимального метода для детекции SNP и аллельного полиморфизма представляет научный интерес. Для изучения полиморфизма К232А в работе использовали 2 метода молекулярно-генетического анализа:1) реал-тайм ПЦР с системой праймеров и зондов, помеченных флюорохромами FAM и R6G; 2) ПЦР-ПДРФ с обработкой продуктов амплификации эндонуклеазой рестрикции BglI и детекцииобразцов в 15% полиакриламидном гелес помощью системы гель-документации ChemiDocXRS+ (BioRad). Исследование было проведено в 2 этапа, соответствующих 2 отчетным периодам в хозяйстве. На 1 этапе было прогенотипировано 200 голов коров с использование реал-тайм ПЦР. Все животные оказались гомозиготными по аллелю А. На 2 этапе был применен метод ПЦР-ПДРФ, с помощью которого установлены генотипы 102 животных - 64 голов коров с генотипом АА; 34 голов с генотипом АК и 4 головы с генотипом КК. Распределение частот соответствовало равновесию Харди-Вайнберга. Частоты аллелей составили А- р=0,79; К- q=0,21. Критерий x2= 0,04(р меньше 0,05). Коровы с генотипом АА имели достоверно высокие показатели по удою +341,8 кг, р не более 0,01; с генотипом АК процентного содержания жира +0,131, р не более 0,01 за 305 дн. 1 лактации. Расчет критерия Стьюдента при сравнении показателей удоя и жирности молока за полную 1 лактацию коров с разными генотипами показал, что все полученные эмпирические значения (t эмп.) находятся в зоне не значимости.