Идентификация Pseudomonas cichorii (Swingle 1925) Stapp 1928 в гидропонном производстве салата | Identification of Pseudomonas cichorii (Swingle 1925) Stapp 1928 in hydroponic culture of lettuce

Russian. Салат посевной, латук посевной или салат латук (Lactuca sativa L.) – вид однолетних травянистых растений рода Латук семейства Астровые (Asteraceae), широко культивируемый повсеместно, в т.ч. в защищенном грунте по гидропонной технологии. Одним из распространенных патогенов салата является Pseudomonas cichorii – возбудитель бактериозов ряда культурных растений. Образцы были предоставлены коммерческой компанией – производителем салата, выращиваемого на проточной гидропонной линии в условиях минимального заражения микроорганизмами. Изучение фитопатогенных бактерий включало ряд этапов: выделение бактерий на полу-селективные питательные среды и получение чистой культуры бактерий; постановка теста на патогенность (вирулентность); изучение фенотипических свойств бактерий; определение таксономического положения выделенных штаммов молекулярными методами. Все исследования проводили в соответствии со стандартными методиками идентификации фитопатогенных бактерий. В результате получено подтверждение распространения вида Pseudomonas cichorii (Swingle 1925) Stapp 1928 в гидропонной культуре салата в РФ. По данным Европейско-средиземноморской организации по защите растений, P. cichorii был впервые описан в России в 1965 г. на основании микробиологических методов идентификации, однако выделенные изоляты сейчас не доступны в коллекциях для подтверждения этого вывода современными диагностическими методами. Двенадцать изолятов P. cichorii были изучены по комплексу биохимических признаков и 4 изолята (01, 04, 06 и 12), показавшие наибольшую агрессивность при проведении инокуляции растений-хозяев и табака, были использованы для секвенирования ДНК фрагмента гена 16S рРНК. Полученные фрагменты ДНК показали высокое сходство (99-100%) с последовательностями P. cichorii из Генбанка. Оценка вирулентности выделенных изолятов на ряде культурных растений, и однородность их биохимических признаков показали, что они представляют группу бактерий, специализированных на салате.

English. Lettuce (Lactuca sativa L.) is an annual herbaceous species of the genus Lettuce, Asteraceae family. As a vegetable crop, it is cultivated everywhere, including hydroponically. One of the common pathogens of lettuce is Pseudomonas cichorii, causing bacterial diseases of several other crops. The samples for the research were provided by a commercial manufacturer of lettuce grown on a flow-through hydroponic line under conditions of minimal microbial contamination. The study of phytopathogenic bacteria includes a number of stages, namely isolation of bacteria on semi-selective culture media and obtaining a pure culture of bacteria; setting a test for pathogenicity (virulence); studying the phenotypic properties of bacteria; determining the taxonomic position of the isolated strains by molecular methods. All studies were conducted in accordance with the standard methods of identification of phytopathogenic bacteria. As a result of the work, the distribution of the species Pseudomonas cichorii (Swingle 1925) Stapp 1928 in the hydroponic lettuce culture in the Russian Federation was confirmed. Although, according to the EPPO database, P. cichorii was first described in Russia in 1965 by microbiological methods, isolated bacteria are currently not available in microbiological collections to confirm this conclusion with appropriate diagnostic methods. Twelve isolates of P. cichoriiwere studied by a biochemical and phytopathological tests, and four isolates (01, 04, 06, and 12) that showed the greatest aggressiveness on host plants and tobacco leaves were identified by DNA sequencing of the 16S rRNA gene fragment. The obtained DNA fragments showed a high similarity (99-100%) with the sequences of P. cichoriifrom the Genebank. Evaluation of the virulence of the isolated isolates on a number of other cultivated plants, and the uniformity of their biochemical characteristics showed that they represent the lettuce specialized bacteria group.