Morphological and molecular characterization of an entomopathogenic fungus, Cordyceps farinosa and phylogenetic analysis of the genus based on the ITS-rDNA and ß-tubulin sequences | توصیف ریخت شناختی و مولکولی قـارچ بیمارگر حشراتCordyceps farinosa و تجزیه و تحلیل تبارشناسی جنس بر اساس ترادف نواحی ITS-rDNA و –tubulinß
2021
ژیلا علیزاده (گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان) | ناصر عیوضیان کاری (گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان) | داود محمدی (گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان) | علی مهرور (گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان)
طی نمـونه برداری از خاک، جــدایهای از قـارچ های بیمـارگر حشـرات با استفاده از تــله گذاری با لارو سن آخر Galleria mellonella جداسازی و با استفاده از ویژگی های ریخت شناختی و تجزیه و تحلیل تبارشناسی مبتنی بر ترادف های ناحیه ITS-rDNA و ß-tubulin طبق روش های بیشینة پارسیمونی ((Maximum Parsimony شناسایی شد. در کنار بررسی های ریخت شناختی و ریخت سنجی، نتایج تجزیه و تحلیل تبارشناسی مبتنی بر هر دو ناحیه ژنومی درستی شناسایی گونه، به نام Cordyceps farinosa را تایید کرد. در جدایه مورد بررسی، کنیدیوم ها با میانگین طولی 83/3 و عرض 98/1 میکرومتر و بیضوی و کنیدی زاها با میانگین طولی 98/4 و عرض 21/2 با گلوبوز عریض در بخش قاعدهای می باشند. طول قطعه تکثیر شده طی PCR برای ناحیه ITS، 615 و برای ناحیه ژنی بتاتوبولین 355جفت باز بود. در تمامی درختان تبارشناسی مبتنی بر هر دو ناحیه ژنی، C. farinosa KJ3 با جدایه C. farinosa CBS 541.81 در یک گروه تکنیایی قرار گرفتند. در درخت تبارشناسی مبتنی بر ترادف ITS-rDNA، گروه متشکل از C. albocitrina وC. coccidioperitheciata و در درخت مبتنی بر ترادف ژنی بتاتوبولین، C. confrogasa به عنوان گروههای خواهری C. farinosa ظاهر شدند. با هدف بررسی کارایی نواحی ژنومی مورد استفاده در مطالعات تبارشناختی جنس به صورت تنها و در ترکیب با هم، درختان تبارشناسی با گونه های مشابه ترسیم و از نظر شاخص ثبات، شاخص بازداری و توپولوژی با هم مقایسه شدند. توپولوژی درخت تبارشناسی حاصل از تلفیق هر دو مکان ژنی پلیتومی کمتر و وضوح بیشتری در بیان روابط گونه ها در مقایسه با درخت مبتنی بر ترادف ITS-rDNA داشت. در مجموع نتایج نشان داد که ترادف ناحیه ژنی بتاتوبولین در مقایسه با ناحیه ITS-rDNA از کارایی بیشتری در مطالعات تبارشناسی در جنس Cordyceps برخوردار می باشد.
Show more [+] Less [-]Bibliographic information
This bibliographic record has been provided by Entomological Society of Iran