The effect of inbreeding on racing performance in warm-blooded trotters in Norway | Effekt av innavl på prestasjonsegenskaper hos varmblodstraver i Norge

English. Det er kjent at innavl vil oppstå i populasjoner med seleksjon, fordi seleksjon reduserer antall dyr som bidrar til neste generasjon. Ugunstige effekter av innavl på prestasjonsegenskaper er tidligere vist hos norsk kaldblodstraver, men ikke hos varmblodstraver i Norge. Formålet med denne oppgaven var derfor å undersøke om det var en effekt av innavl på prestasjonsegenskaper hos varmblodstraver i Norge.Datasettet bestod av 1217 hester født 1988 og 2006/2007. Pedigreefilen ble generert ved å spore tilbake forfedrene til de 1217 hestene, og inneholdt totalt 8483 individer. Gjennomsnittlig dybde var 7,75 og 9,24 generasjoner for hester født henholdsvis 1988 og 2006/2007. Genotypeinformasjon var tilgjengelig for 240 av hestene født 2006 og 2007, og ble benyttet for å undersøke pedigreekvaliteten hos norsk varmblodstraver. Innavlskoeffisienter (F) ble estimert basert på pedigree (Fped) og genomiske data (Fsnp og Fhom). En klar sammenheng mellom innavlskoeffisientene indikerte en god pedigree. For å utnytte et større datamateriale ble effekten av innavl derfor estimert basert på Fped for prestasjonsvariablene; roten av kumulerte antall starter (t-start), 4-roten av kumulerte, transformerte og standardiserte inntjente penger per start (t-krinn) og logit-transformerte kumulerte diskvalifikasjoner per start (t-disk). Egenskapene var kumulert for individene over 3-5 års sesongen. Effekten ble estimert for 807 individer født årgangene 1988 og 2006/2007 med en lineær dyremodell med faste effekter og en lineær modell med faste effekter hvor den additive genetiske effekten var ekskludert. For begge modellene vil en økende innavlskoeffisient påvirke prestasjonsvariabelen t-krinn i negativ retning, og for dyremodellen var effekten signifikant. Modellene med og uten additiv genetisk effekt gir henholdsvis 0,366 og 0,269 standardavvik dårligere prestasjon for en hest som er 10 % innavlet. Modellen uten den additive genetiske effekten gir en signifikant effekt av innavl på t-disk, noe som indikerer at individer med høy F tjener mindre og blir disket mer. Dette er et betydelig handicap i løpssammenheng, og bør stimulere oppdrettere til å velge hingster som gir avkom med lav innavlskoeffisient. An increase in inbreeding as a response to selection is well known. Selection reduces thenumbers individuals that contribute to the next generation. Unfavorable effects of inbreedinghave been found in Norwegian cold-blooded trotters, but never in warm-blooded trotters inNorway.This study was based on 1217 Norwegian warm-blooded trotters, born in 1988 and2006/2007. By tracking ancestors of the 1217 horses back to their founders, the pedigree datawas generated. Complete generation equivalent (CGE) showed a depth in pedigree of 7.75and 9.24 generations for horses born in 1988 and 2006/2007, respectively. Genotype wasavailable for 240 horses born in 2006 and 2007. Utilizing genotypes, the quality ofpedigreedata was investigated. Inbreeding coefficients (F) were estimated by utilizing bothpedigree (Fped) and genomic data (Fsnp and Fhom), and showed a high correlation between theparameters. To exploit a larger data set, the effect of inbreeding was estimated based on Fpedfor the performance traits; power transformed starts with the square root (t-start), fourth roottransformation of cumulated, transformed and standardized earnings per start (t-krinn) and alogit-transformed cumulated disqualifications per start (t-disk). The traits were cumulated forthe individuals over 3-5 years of age. The effect was estimated for 807 horses born 1988 and2006/2007, using a linear animal model with fixed effects and another linear model with fixedeffects but ignoring the additive genetic effect. For both models, an increasing inbreedingcoefficient influenced the t-krinn negatively, and for the animal model, the effect wassignificant. A horse with an Fped value of 10 % is expected to perform respectively 0.366 and0.269 standard deviation units worse than a non-inbred horse, based on the models with andwithout the additive genetic effect. The model without the additive genetic effect gave asignificant effect of inbreeding for t-disk, which indicated that horses with a higher level ofinbreeding perform poorer than horses with a lower level of inbreeding. This is considered ahandicap in racing, and should encourage breeders to use a stallion that produce offspringwith a low inbreeding coefficient.

M-HV