Frequency assessment of SNP rs211250281 of the AGPAT6 gene in cattle breeds | Оценка частоты встречаемости SNP rs211250281 гена AGPAT6 у пород крупного рогатого скота

Russian. В связи с проведением селекции крупного рогатого скота по признаку жирномолочности, актуальным является поиск ДНК-маркеров, ассоциированных с содержанием жира в молоке коров. Одним из таких генов-кандидатов является ген agpat6, кодирующий глицерол-3-фосфат ацилтрансферазу 6 (AGPAT6). Известен однонуклеотидный полиморфизм rs211250281 (g27: 36520069 G/T), который расположен в промоторной области agpat6 и ассоциирован с содержанием жира в молоке коров. Цель работы - провести оценку частоты встречаемости полиморфизма rs211250281 у разных пород крупного рогатого скота отечественной селекции. Исследования проводились на образцах ДНК коров 8 пород: айрширской (n=56), абердин-ангусской (n=27), герефордской (n=33), якутской (n=41), ярославской (n=48), калмыцкой (n=49), костромской (n=38) и чёрно-пестрой голштинизированной (n=49). Генотипирование коров проводили методом ПЦР-ПДРФ. Обнаружены низкие значения частоты встречаемости генотипа TT гена AGPAT6 (rs211250281) у коров исследованных пород с высокими показателями жирномолочности, т.е. у коров якутской, айрширской и ярославской пород. Частоты встречаемости генотипа TT составили 0,024; 0,036 и 0,083 соответственно. У остальных изученных пород значение показателя находилось в интервале от 0,105 до 0,259.

English. Selection of cattle with high milk fat content is one of the important tasks of dairy cattle breeding. In this regard, the search for DNA markers associated with milk fat content is relevant. Gene encoding glycerol-3-phosphate acyltransferase 6 (AGPAT6) involved in triacylglycerol biosynthesis is one of such candidate genes. The SNP rs211250281 (g27: 36520069 G/T) in agpat6 gene was found to located in the promoter region and was associated with the milk fat content in cattle. The aim of this study was frequency assessment of SNP rs211250281 of the agpat6 gene in different breeds of Russian selection. The studies were carried out on DNA samples from eight cattle breeds: Ayrshire (n=56), Angus (n=27), Hereford (n=33), Yakut (n=41), Yaroslavl (n=48), Kalmyk (n=49), Kostroma (n=38) and holsteinized Black-and-White cows (n=49). Genotyping of cows was carried out by PCR-RFLP method. The lowest values of TT genotypes frequency were found in cattle breeds with high levels of milk fat content, namely in Yakut, Ayrshire, and Yaroslavl cows. The frequencies of TT genotype occurrence were 0.024; 0.036 and 0.083 respectively. In other studied breeds, the value of the indicator was in the range from 0.105 to 0.259.