The genome of Theobroma cacao.
2011
Argout, Xavier | Salse, Jerome | Aury, Jean-Marc | Guiltinan, Mark J | Droc, Gaetan | Gouzy, Jerome | Allegre, Mathilde | Chaparro, Cristian | Legavre, Thierry | Maximova, Siela N | Abrouk, Michael | Murat, Florent | Fouet, Olivier | Poulain, Julie | Roguet, Yolande | Rodier-Goud, Maguy | Barbosa-Neto, Jose Fernandes | Sabot, Francois | Kudrna, Dave | Ammiraju, Jetty Siva S | Schuster, Stephan C | Carlson, John E | Sallet, Erika | Schiex, Thomas | Dievart, Anne | Kramer, Melissa | Gelley, Laura | Shi, Zi | Bérard, Aurélie | Viot, Christopher | Boccara, Michel | Risterucci, Ange Marie | Guignon, Valentin | Sabau, Xavier | Axtell, Michael J | Ma, Zhaorong | Zhang, Yufan | Brown, Spencer | Bourge, Mickael | Golser, Wolfgang | Song, Xiang | Clement, Didier | Rivallan, Ronan | Tahi, Mathias | Akaza, Joseph Moroh | Pitollat, Bertrand | Gramacho, Karina | d'Hont, Angélique | Brunel, Dominique | Infante, Diogenes | Kebe, Ismael | Costet, Pierre | Wing, Rod | Mccombie, W Richard | Guiderdoni, Emmanuel | Quetier, Francis | Panaud, Olivier | Wincker, Patrick | Bocs, Stephanie | Lanaud, Claire | Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP) | Génomique métabolique (UMR 8030) ; Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Développement et amélioration des plantes (UMR DAP) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Laboratoire Génome et développement des plantes (LGDP) ; Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB) | Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | Laboratoire Génome et développement des plantes (LGDP) ; Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Ecology and Evolutionary Biology [Tucson] (EEB) ; University of Arizona | Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) | Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro) | Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) | Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech | Polymorphismes d'intérêt agronomique (UMR PIA) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) | Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad) | Institut des sciences du végétal (ISV) ; Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux (EPGV) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) | Animalerie spécialisée ; Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2
International audience
Show more [+] Less [-]English. We sequenced and assembled the draft genome of Theobroma cacao, an economically important tropical-fruit tree crop that is the source of chocolate. This assembly corresponds to 76% of the estimated genome size and contains almost all previously described genes, with 82% of these genes anchored on the 10 T. cacao chromosomes. Analysis of this sequence information highlighted specific expansion of some gene families during evolution, for example, flavonoid-related genes. It also provides a major source of candidate genes for T. cacao improvement. Based on the inferred paleohistory of the T. cacao genome, we propose an evolutionary scenario whereby the ten T. cacao chromosomes were shaped from an ancestor through eleven chromosome fusions.
Show more [+] Less [-]AGROVOC Keywords
Bibliographic information
This bibliographic record has been provided by Institut national de la recherche agronomique