Epidemiology of zoonosis in wild boar (Sus scrofa) from an insular Mediterranean area, Corsica | Epidémiologie de zoonoses du sanglier (Sus scrofa) dans un milieu méditerranéen insulaire, la Corse

English. This thesis aimed to study the epidemiology of zoonosis in wild boar in Corsica and to provide new elements to analyse and manage the zoonotic risk. The first bibliographical part describes how to analyse a zoonotic risk and which data are needed to estimate it, highlights that wild boar is potentially carrier of numerous pathogens and is a good biological model to survey diseases transmitted to Humans by ingestion or carcass handling, and finally presents the hunting and breeding context in Corsica. The second part presents the active surveillance device built on the whole island to collect epidemiological data, and then the study of three zoonotic pathogens (respectively diseases): Trichinella britovi (trichinellosis), Toxoplasma gondii (toxoplasmosis) and Mycobacterium bovis (bovin tuberculosis). We firstly showed that, although an outbreak of trichinellosis was detected in 2004 in pigs and one fox, the risk is difficult to estimate nowadays due to difficulties in interpreting diagnostic tests in wildlife. However, the risk is still potential and preventive practices need to be maintained (cooking meat, systematic test of commercialised carcasses). Secondly, we show evidence of a strong risk of toxoplasmosis on the whole island, which is stronger in areas with high farm densities. Thirdly, the risk of tuberculosis appears a major one to consider, M. bovis of identical genotypes being found in wild boars, cattle, and pigs of the same areas. Finally, our work leads to suggest a better management of wild and domestic carcasses, and the need of a long-term coordination of the surveillance device built to study zoonosis and detect emerging diseases in Corsica.

French. Cette thèse a pour objectif l'étude épidémiologique de zoonoses chez le sanglier en Corse afin d'éclairer l'analyse et la gestion du risque zoonotique. La première partie décrit la démarche d'analyse du risque et les données nécessaires à son estimation, met en évidence que le sanglier, porteur potentiel de nombreux agents pathogènes, est un modèle biologique intéressant pour le suivi de maladies transmissibles à l'Homme par ingestion ou manipulation de carcasses, et décrit le contexte d'étude, la Corse, notamment sur le plan cynégétique et de l'élevage. La seconde partie présente le dispositif mis en place pour la collecte des données, un réseau d'épidémiosurveillance active à l'échelle de la région insulaire, puis l'étude épidémiologique de trois agents zoonotiques (respectivement maladies) : Trichinella britovi (trichinellose), Toxoplasma gondii (toxoplasmose) et Mycobacterium bovis (tuberculose bovine). A l'issue de nos travaux, le risque de trichinellose, avéré en 2004, demeure difficile à évaluer mais plausible, nécessitant le maintien des consignes de prévention (cuisson de la viande, test des carcasses commercialisées). Le risque de toxoplasmose est fort sur l'ensemble de l'île et davantage encore dans les zones à forte densité d'exploitations agricoles. Le risque de tuberculose apparaît majeur à considérer, le bacille étant présent à la fois chez les sangliers et chez des porcs ou bovins de quatre régions corses. Nos travaux concluent en l'importance d'une meilleure gestion des carcasses et viscères d'animaux sanvages et domestiques, et la nécessité d'une coordination pérenne du dispositif mis en place pour le suivi des zoonoses en Corse.