РАЗРАБОТКА И ВАЛИДАЦИЯ ТЕСТ-СИСТЕМЫ АНАЛИЗА ПОЛИМОРФИЗМА ПОЛНОГО МИТОХОНДРИАЛЬНОГО ГЕНОМА СВИНЕЙ
2023
Бакоев Н.Ф. | Кошкина О.А. | Харзинова В.Р. | Сермягин А.А. | Зиновьева Н.А.
Russian. В данной работе разработана тест-система праймеров и оптимизированы условия проведения ПЦР для амплификации полных последовательностей митохондриального генома свиней. Валидация разработанной тест-системы проведена на образцах четырех трансграничных пород свиней и диких кабанов двух регионов страны. В результате, получены нуклеотидные последовательности полных митохондриальных геномов образцов свиней (n=17) и дикого кабана (n=3) длиною 16611 п.н. В исследуемой выборке животных было выявлено 16 гаплотипов, из которых 13 были обнаружены у домашних свиней и 3 – у дикого кабана. Общих гаплотипов среди домашних свиней и диких кабанов выявлено не было. На основании полученных полных последовательностей МТ-ДНК, проведен расчет параметров генетического разнообразия, который выявил, что дикие кабаны превосходят породы свиней, как по среднему числу нуклеотидных различий, так и по значениям нуклеотидного разнообразия: k=106,00 и π=0,00638. Филогенетический анализ показал, что, несмотря на небольшую выборку исследованных животных, были определены все пять известных гаплогрупп рода Sus sсrofa A, B, C, D, и E., что свидетельствует об универсальности разработанной тест-системы.
Show more [+] Less [-]AGROVOC Keywords
Bibliographic information
This bibliographic record has been provided by Marina Sokolova Publishings