Automatisation de l'analyse de vidéos comportementales en écotoxicologie : solutions basées sur les logiciels libres
2024
Petitjean, Quentin | Royauté, Raphaël | Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (UR EABX) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS) ; AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Fiche thématique N°48 - avril 2024 du Réseau ECOTOX
Show more [+] Less [-]French. Les mouvements et comportements des animaux sont souvent considérés comme les réponses lesplus sensibles et les plus précoces face à l’exposition à un stress, y compris chimique. Pourtant, alors que les altérations comportementales peuvent avoir des effets importants sur les performances des individus, les effets des contaminants sur les traits comportementaux ont jusqu’ici été largement négligés . L’utilisation croissante des tests comportementaux en écotoxicologie comporte cependant de nombreux défis techniques. Ils nécessitent, pour la plupart, l’utilisation de matériel vidéo avec un temps de traitement souvent conséquent. Pour y remédier, de nombreuses solutions logicielles sont maintenant disponibles allant de l’aide au scoring manuel jusqu’à l’automatisation complète de la détection des individus et de leurs comportements. Nous synthétisons ici plusieurs de ces solutions avec une emphase sur les logiciels libres en détaillant les avantages et inconvénients de ces différents outils.
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