Characteristic of Rf-lines from sunflower collection of VNIIMK using microsatellite DNA-markers | Характеристика Rf-линий подсолнечника коллекции ВНИИМК с помощью микросателлитных маркеров ДНК

English. Sunflower Helianthus annuus L. is one of the most profitable oil crops. The task of sunflower breeding is development of highly performing hybrids. The genetic diversity of initial germplasm is very important in this case. Molecular-genetic markers, particularly microsatellites, are used for the estimation of such material. The research purposes concluded in the genotyping of an Rf-lines collection, and analyzing genetic diversity of them using microsatellite markers. Fifty four Rf-lines from a collection of V.S. Pustovoit All-Russian Research Institute of Oil Crops have been analyzed using 12 SSR-markers. Genetic passports of all studied lines were composed by these markers, the main indicators of SSR-loci information capacity were determined. DNA was isolated from the mix of five dry seed germs of each line. The collection is characterized with a high genetic diversity, in total (Nа) 55 alleles were obtained, in average 4.58 alleles per a locus. An effective allele amount (Ne) averaged 2.48. An index of polymorphic information content (PIC) was 0.51. A level of line heterogeneity was quite low (5.5%) that certifies their good genetic uniformity. Due to the results, the collection was divided in two cluster at a agglomeration level of 15.8. A minimal genetic distance between lines was equal 0. Eleven lines formed one cluster. The most lines (43 pcs) formed another cluster. The uniqueness of the collection was 91%.

Russian. Подсолнечник – одна из наиболее рентабельных масличных культур. Задача селекции подсолнечника – создание новых высокоурожайных гибридов. Для ее решения важное значение имеет генетическое разнообразие исходного селекционного материала. Оценить это разнообразие можно с использованием молекулярно-генетических маркеров, в частности микросателлитов. Цели работы - генотипирование коллекции Rf-линий и анализ ее генетического разнообразия с помощью микросателлитных маркеров. Анализ для 54 Rf-линий коллекции ВНИИ масличных культур выполнен с помощью 12 SSR-маркеров. По этим маркерам были составлены генетические паспорта для всех изучаемых линий и определены основные показатели информативности SSR-локусов. ДНК была выделена из смеси сухих зародышей пяти семян каждой линии. Коллекция характеризовалась большим генетическим разнообразием, в сумме были получены (Nа) 55 аллелей, в среднем 4,58 аллеля на локус. Эффективное число аллелей (Ne) в среднем 2,48. Индекс полиморфного информационного содержания (PIC) составил 0,51. Уровень гетерогенности линий был достаточно низким (5,5%), что говорит об их хорошей генетической выровненности. По результатам анализа коллекция была разделена на два кластера на уровне объединения 15,8. Минимальная генетическая дистанция между линиями составила 0. Первый кластер cформировали 11 линий. Большая часть линий (43 шт.) образовали второй кластер. Уникальность коллекции составила 91%.