A 180 My-old female-specific genome region in sturgeon reveals the oldest known vertebrate sex determining system with undifferentiated sex chromosomes

Kuhl, Heiner | Guiguen, Yann | Höhne, Christin | Kreuz, Eva | Kang, Du | Klopp, Christophe | Lopez-Roques, Celine | Yebra-Pimentel, Elena Santidrian | Ciorpac, Mitica | Gessner, Jörn | Holostenco, Daniela | Kleiner, Wibke | Kohlmann, Klaus | Lamatsch, Dunja, K | Prokopov, Dmitry | Bestin, Anastasia | Bonpunt, Emmanuel | Debeuf, Bastien | Haffray, Pierrick | Morvezen, Romain | Patrice, Pierre | Suciu, Radu | Dirks, Ron | Wuertz, Sven | Kloas, Werner | Schartl, Manfred | Stöck, Matthias | Leibniz Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries (IGB) | Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons = Fish Physiology and Genomics Institute (LPGP) ; Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes (Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Julius-Maximilians-Universität Würzburg = University of Würzburg [Würsburg, Germany] (JMU) | The Xiphophorus Genetic Stock Center, Department of Chemistry and Biochemistry ; Texas State University | Plateforme Bio-Informatique - Génotoul ; Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL) ; Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRAE) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-IR BioInfOmics ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique (GeT-PlaGe) ; Plateforme Génome & Transcriptome (GET) ; Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL) ; Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL) ; Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Future Genomics Technologies | « Danube Delta » National Institute for Research and Development [Tulcea] | Academy of Agricultural and Forestry Sciences "Gheorghe Ionescu-Sisesti" (A.A.F.S.) | Leopold Franzens Universität Innsbruck - University of Innsbruck | Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences (SB RAS) | Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français (SYSAAF) | L’Esturgeonnière | SCEA Sturgeon | This work was funded through COFASP/ERANET (STURGEoNOMICS) by the German Federal Ministry of Food andAgriculture through the Federal Office for Agriculture and Food (grant nos. 2816ERA04G, 2816ERA05G) to M. Stöck,S.W., J.G. and M. Schartl; by the French National Research Agency (grant nos. ANR-16-COFA-0002) to YG, CK and CR,and by the Romanian Executive Agency for Higher Education, Research Development and Innovation Funding(UEFISCDI, contract 3/2017) to RS, MC and DH. This research was also in part supported by the Russian ScienceFoundation (RSF) to DP (grant number 18-44-04-007), by the Deutsche Forschungsgemeinschaft to MSch (DFG SCHA408/14-1), and by a European Maritime and Fisheries Fund to YG (EMFF/FEAMP project SIBERSEX). Research onA.gueldenstaedtii was supported by a European Maritime and Fisheries Fund to YG (EMFF/FEAMP project S’STURGEON). | ANR-16-COFA-0002,STURGEoNOMICS,Genome-based approaches for improvement of aquaculture in two marine sturgeon species: Atlantic sturgeon (Acipenser oxyrinchus) and Beluga (Huso huso)(2016)