Do temperature and population size structure influence the quantity of fish eDNA in water?
2023
Hervé, Alix | Domaizon, Isabelle | Baudoin, Jean-Marc | Dejean, Tony | Gibert, Pierre | Valentini, Alice | Logez, Maxime | SPYGEN [Le Bourget-du-Lac] | Pôle Écla - écosystèmes lacustres (ECLA) ; Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Service fonctionnement, préservation et restauration des écosystèmes aquatiques continentaux et marins (OFB Service EcoAqua) ; OFB Direction de la recherche et de l’appui scientifique (OFB - DRAS) ; Office français de la biodiversité (OFB)-Office français de la biodiversité (OFB)-OFB Direction de la recherche et de l’appui scientifique (OFB - DRAS) ; Office français de la biodiversité (OFB)-Office français de la biodiversité (OFB) | Risques, Ecosystèmes, Vulnérabilité, Environnement, Résilience (RECOVER) ; Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL) ; Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (Fédération OSUG) | RiverLy - Fonctionnement des hydrosystèmes (RiverLy) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Office Français de la Biodiversité, SPYGEN, INRAE, Association Nationale de la Recherche et de la Technologie
International audience
Show more [+] Less [-]English. Various factors can influence the concentration of eDNA found in the environment and blur the link between eDNA results and in situ fish abundances, biomasses or even occurrences. We studied the influence of one abiotic factor, the temperature, and one biotic factor, the fish size class, on the amount of fish eDNA detectable in water. To do so, we conducted two controlled experiments using tench (Tinca tinca, L) placed into outdoor mesocosms during 1 week. The quantification of fish eDNA abundances was performed using quantitative PCR after filtrating a large volume of water (30 L). The Bayesian hierarchical ANOVAs performed on qPCR results did not detect the effect of size class on eDNA amount, but fish eDNA concentration was shown to increase significantly when temperature rose by 6 °C (no effect detected at 3 °C). This suggests that fish assemblage quantification of two thermally contrasting sites through eDNA is not directly comparable.
Show more [+] Less [-]AGROVOC Keywords
Bibliographic information
This bibliographic record has been provided by Institut national de la recherche agronomique
