Le macrobenthos de substrats meubles en zone infralittorale Corse - Indice et méthodologie adaptée pour un diagnostic écologique facilité

English. At the time where the safeguarding and the conservation of the environment are a need for the Man, various ecological quality indicators are currently followed to evaluate the human influences; among those the soft-bottom macrofauna. On the basis of some of their characteristics, the calculation of various biotic indices makes possible to qualify the meadow. However, before this qualification, the analysis of the macrobenthos is long and tedious. Two problems involved in their study exist: 1. In Corsica, the classically calculated biotic indices do not give an account of the existence of impacted settlements in oligotrophic coastal area and subjected to weak human influences. 2. The length of their study related to the difficulty of identification prevented a prompt response to the decision makers. To solve these problems, the adaptation of the calculation of a biotic index to the Corsican environmental conditions as well as the means of limiting the length of studies of the soft-bottom macrobenthos is required. For the adaptation of an index and to give an account of the natural variability of the settlements, eight habitats linked with settlements were defined around Corsica. Then, the J’MAMBI, based on the polluo-sensitivity of species, the richness, the diversity of the settlements and their equitability was developed, with references of good and bad ecological conditions for each habitats type. The application of this index makes possible to highlight fine variations in ecological qualities. To facilitate the identification and to decrease the time of soft-bottom macrobenthos’ study, the principle of taxonomic sufficiency is applied to the J’MAMBI. This principle makes possible to bring to the decision makers and to managers of such environmental studies, a facility diagnosis and a prompt response. Around the island, the identification at the "family" level is sufficient to give an account of ecological quality definite by a work to the "species" level. Thanks to "Benthic Methodology Simplification" or BeMSi, coupling the J’MAMBI and the facilitated identification, the two posed problems were solved. The utility of this methodology was put ahead within the framework of fish-farming survey, of outfall survey, of bay survey. Its sensitivity is also sufficient compared to other indices based on other indicators like the posidonia. Thank to this study, two types of research are possible: • The fundamental research grouping the "species" level identification and the J’MAMBI in order to improve the specific knowledge of microbenthic settlements and their reaction under or without disturbances. • The applied research using the BeMSi in order to obtain a general overview of the ecological quality status of an area and to help with decision making. In the future, it would be interesting to apply the results of this thesis to long temporal series of data and to other geographical areas in order to confirm the robustness of the index and the methodology developed.

French. A l’heure où la préservation et la conservation de l’environnement sont d’actualité pour l’Homme, différents indicateurs de qualité écologique sont couramment suivis pour évaluer les influences anthropiques ; parmi ces indicateurs de qualité, le macrobenthos de substrats meubles. Sur base de certaines de leurs caractéristiques, le calcul de différents indices biotiques permet de qualifier le milieu. Cependant, avant cette qualification, l’analyse du macrobenthos est longue et fastidieuse. Deux problèmes liés à leur étude existent : 1. En Corse, les indices biotiques classiquement calculés ne rendent pas compte de l’existence de peuplements impactés en zone côtière oligotrophe et soumis à de faibles influences humaines. 2. La longueur de leur étude liée à la difficulté d’identification empêche une réponse rapide aux décideurs. Pour solutionner ces problèmes, l’adaptation du calcul d’un indice biotique aux conditions environnementales corses ainsi que le moyen de limiter la durée des études du macrobenthos de substrats meubles sont recherchés. Dans l’optique d’adaptation d’un indice et pour rendre compte de la variabilité naturelle des peuplements, huit habitats considérant les peuplements macrobenthiques ont été définis autour de la Corse. Puis, le J’MAMBI, basé sur la polluo-sensibilité des espèces, la richesse, la diversité des peuplements et leur équitabilité a été mis au point, avec des références de bonne et mauvaise conditions écologiques pour chacun des types d’habitats. L’application de cet indice permet de mettre en évidence de fines variations dans les qualités écologiques observées. Pour faciliter l’identification et diminuer le temps d’étude du macrobenthos de substrats meubles, le principe de suffisance taxonomique est appliqué au J’MAMBI. Ce principe permet d’apporter aux décideurs et gestionnaires de telles études un diagnostic environnemental facilité et une réponse rapide. Sur le pourtour insulaire, le niveau d’identification taxonomique "famille" est suffisant pour rendre compte de la qualité écologique définie par un travail à l’"espèce". Grâce au "Benthic Methodology Simplification" ou BeMSi, regroupant le J’MAMBI et l’identification facilitée, les deux problèmes posés ont été résolus. L’utilité de cette méthodologie a été mise en avant dans le cadre de suivis aquacoles, de suivis d’émissaires en mer, de distinctions de qualité entre baies ou au sein d’une même baie. Sa sensibilité est également suffisante par rapport à d’autres indices basés sur d’autres indicateurs comme la posidonie. Ainsi grâce à l’emploi de cette méthodologie, deux types de recherche sont possibles : • La recherche fondamentale avec une identification à l’"espèce" et l’application du J’MAMBI afin d’améliorer les connaissances spécifiques des peuplements macrobenthiques et de leur réaction à l’influence de perturbations. • La recherche appliquée avec application du BeMSi, identification à la "famille" et application du J’MAMBI, afin d’obtenir une connaissance générale de l’état écologique d’une zone et aider à la prise de décision. Dans les années à venir, il serait intéressant d’appliquer les résultats de cette thèse à de plus longues séries temporelles de données et à d’autres zones géographiques afin de confirmer la robustesse de l’indice et de la méthodologie développée au cours de cette thèse de doctorat.

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