Study of the impact of viticultural practices on arbuscular mycorrhizal fungi associated with vines | Etude de l'impact des pratiques viticoles sur les champignons mycorhiziens à arbuscules associés à la vigne

Thèse de doctorat de physiologie végétale

English. Arbuscular mycorrhiza, a mutualistic symbiosis established between plants andarbuscular mycorrhizal fungi (AMF), providesmany ecosystem services such as improved soilstructure, increased plant growth and nutrition,and improved tolerance to biotic and abioticstresses. However, intensive agricultural practicesand the use of phytosanitary products as forexample herbicide and fungicides, have a strongimpact on communities of soil microorganisms,including arbuscular mycorrhizal fungi, as well ason biological mechanisms within the ecosystem.This thesis wotk is part of the European Biovineproject supported by the European Commissionthrough the CORE Organic Cofund.The aim of this research work was to determinethe influence of plant diversity, within a cover, onthe structure of arbuscular mycorrhizal fungicommunitiesassociated with grapevine, but also on thebiological functioning of the soil (microbialenzymatic activities). Our research also led us tostudy the effect of the genetic variability ofgrapevine in the structuring of arbuscularmycorrhizal fungi communities. On this point, aneffect of rootstock and grape variety on thecomposition of the arbuscular mycorrhizal fungicommunity was shown. However, this did notmodify the Shannon diversity indices. Theinfluence of grapevine age on the organisation ofarbuscular mycorrhizal fungi communities wasalso studied. In a Champagne vineyard, we wereable to show a significant change in thecomposition of arbuscular mycorrhizal fungicommunities between a recently plantedvineyard and old grapevines, suggesting a role forgrapevine vigour, carbon allocation on therecruitment of arbuscular mycorrhizal fungicommunities

French. La mycorhize à arbuscules, symbiose mutualiste établie entre les plantes et les champignons mycorhiziens à arbuscules (CMA), apporte de nombreux services écosystémiques comme l’amélioration de la structure des sols, l’augmentation de la croissance et de la nutrition des plantes ainsi qu’une meilleure tolérance aux stress biotiques et abiotiques. Cependant, les pratiques agricoles intensives et l’utilisation de produits phytosanitaires ont un impact fort sur les communautés de microorganismes telluriques dont les CMA, ainsi que sur les mécanismes biologiques au sein de l’écosystème. Cette thèse s’inscrit dans le cadre du projet européen Biovine soutenu par la Commission Européenne à travers le fond européen de soutien à la recherche transnationale : CORE Organic Cofund. Ce travail de recherche a eu pour objectif de déterminer l’influence de la diversité végétale, au sein d’un couvert, sur la structure des communautés de CMA associés à la vigne mais également sur le fonctionnement biologique des sols (activités enzymatiques microbiennes). Nos recherches nous ont également amené à étudier l’effet de la variabilité génétique de la vigne dans la structuration des communautés de CMA. Sur ce point, un effet du porte-greffe et du cépage sur la composition de la communauté de CMA a pu être montré. Néanmoins sans pour autant modifier les indices de diversité. L’influence de l’âge des vignes sur l’organisation des communautés de champignons mycorhiziens à arbuscules a également fait l’objet d’une étude. Sur un vignoble de Champagne, nous avons pu montrer un changement important dans la composition des communautés de CMA entre un vignoble récemment planté et des vignesanciennes suggérant un rôle de la vigueur de la vigne, l’allocation en carbone et sur le recrutement des communautés de CMA.