بررسی ارتباط فیلوژنتیکی جدایههای ویروس کوتولگی سبزرد هندوانه (WmCSV) استان سیستان و بلوچستان بر اساس توالی ژن رمز کننده پروتئین پوششی
2020
مجید جعفری | زهرا صادقی | سعید نصراله نژاد | احمد رضا شاهرخی
ویروسکوتولگی سبزرد هندوانه (Watermelon chlorotic stunt virus, WmCSV) به جنس Begomovirus از خانواده Geminiviridae تعلق دارد که بیشترین تعداد گونه را در مقایسه با سایر جنسهای آلودهکننده گیاهان در خانواده Geminiviridae دارد و از طریق سفید بالک منتقل میشود. به منظور شناسایی و بررسی تنوع ژنتیکی WmCSV در محصولات کدوییان جنوب شرق کشور در سالهای 95 و 96 بازدیدهایی از مزارع شهرستانهای زابل، زهک، هامون، هیرمند، نیمروز، زاهدان، سراوان، ایرانشهر، نیکشهر، سرباز، کنارک و چابهار در استان سیستان و بلوچستان انجام گرفت و از محصولات مختلف کدوییان شامل خربزه، طالبی، هندوانه، کدو مسمایی و حلوایی نمونهبرداری شد. از گیاهان دارای نشانههای زردی رگبرگ، کوتولگی گیاه، سبزردی و پیسکیشدن برگها، بدشکلی شدید و کوچک شدن اندازه میوه نمونهبرداری شد و نمونهها به آزمایشگاه منتقل شدند و سپس استخراج دی ان ای کل گیاه انجام شد. جهت شناسایی WmCSV از آغازگرهای اختصاصی Gem-CP-V-5' و Gem-CP-V-3' شناساییکننده جنس بگوموویروس در کدوییان استفاده شد. محصولات پی سی آر مورد انتظار، به طول 550 جفت باز از ژن رمزکننده پروتئین پوششی، مورد توالییابی قرار گرفتند. نتایج تعیین توالی مربوط به 16 نمونه از محصولات پی سی آر متعلق به مناطق مختلف استان آلودگی نمونهها را به WmCSV تأیید کرد. آنالیز فیلوژنتیکی نتایج توالییابی، در این پژوهش با برنامه MEGA 5، جدایههای WmCSV از استان سیستان و بلوچستان را در دو گروه مجزا تفکیک کرد. نتایج نشان داد که این گروهبندی ارتباطی با نوع میزبان و یا منطقه جغرافیایی نداشته و برخی جدایههای استان ارتباط نزدیکی با جدایههای کشورهای عمان و عربستان داشتند.
Show more [+] Less [-]Bibliographic information
This bibliographic record has been provided by Directory of Open Access Journals