مطالعه ارتباط ژنومی چند جمعیتی مشترک برای شناسایی مکان های ژنومی موثر بر چندقلوزایی در گوسفند
2022
محسن قلی زاده | سید مهدی اسماعیلی فرد
چندقلوزایی یکی از مهمترین صفات اقتصادی در گوسفند با تنوع داخل و بین نژادی است. این مطالعه به منظور شناسایی مکانهای ژنومی موثر بر چندقلوزایی در گوسفند با رویکرد مگاآنالیز مطالعه ارتباط ژنومی و با استفاده از دادههای ژنوتیپی و فنوتیپی شش نژاد گوسفند از پایگاه داده انجام شد. کنترل کیفیت با استفاده از نرم افزار Plink و ایمپیوتیشن با روش LD-kNNi انجام شد. مگاآنالیز با استفاده از مدل خطی مختلط در نرم افزار TASSEL با در نظر گرفتن خویشاوندی و ساختار جمعیت انجام شد. پس از پایان کنترل کیفیت، تعداد 305 حیوان و 351615 نشانگر SNP با متوسط MAF برابر با 33/0 برای ادامه تجزیه مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج مگاآنالیز، یک SNP را روی کروموزوم 21 در سطح ژنوم و 10 SNP در سطح کروموزومی روی کروموزوم های 1، 2، 3، 14، 17 و 22 شناسایی کرد که بهطور معنیداری با چندقلوزایی در گوسفند در ارتباط بودند. ژنهای OPCML، GULP1، RBP4، MMP2 و LPCAT2 شناسایی شده در این تحقیق، نقش موثری در باروری و موفقیت آبستنی دارند. نتایج این تحقیق میتواند در درک ساز و کار ژنتیکی کنترلکننده چندقلوزایی در گوسفند مورد استفاده قرار گیرد.
Show more [+] Less [-]Bibliographic information
This bibliographic record has been provided by Directory of Open Access Journals