Genetic diversity estimation of the Soviet Heavy Draft horse breed using DNA microsatellite loci | Оценка генетического разнообразия советской тяжеловозной породы лошадей с использованием микросателлитных локусов ДНК

English. The Soviet Heavy Draft horse breed is a unique achievement of domestic breeders. The research goal is to monitor the genetic structure of the Soviet Heavy Draft horse breed by microsatellite DNA loci, determine the genetic diversity in the population, and study the genetic characteristics of lines in the breed using microsatellite markers. The study object was purebred Soviet Heavy Draft horses of confirmed origin. The research materials were DNA certificates with the results of genotyping of horsehair samples at 17 microsatellite loci. The following parameters were calculated during genetic-population analysis: the total number of alleles per locus (Na), allele frequency, level of polymorphism (Ae), degree of observed (Ho) and expected (He) heterozygosity. The intrapopulation inbreeding coefficients (Fis), fixation coefficient (Fst), inbreeding coefficient of individuals in the population (Fit) were estimated using F-statistics methods and using Microsoft Excel 2010 software. The scientific novelty of the study lies in the study of genetic characteristics and intralinear differentiation, the availability of internal resources for the successful development of the Soviet Heavy Draft breed without attracting extraneous genetic potential. When testing the Soviet Heavy Draft horses, 118 alleles were determined from 17 microsatellite DNA loci, of which the most common alleles are HTG4M (0.449), VHL20O (0.378), HMS6L (0.545), HTG10M (0.391), HTG7M (0.132), HMS2H (0.564). Rare alleles were identified: ANT4 M (0.002), HMS7Q (0.002), HTG6R (0.002), HMS3O (0.002). The research results allow us to conclude that almost all lines of the Soviet Heavy Draft breed do not have intrapopulation inbreeding, and the breeding methods used contribute to maintaining genetic diversity in the population.

Russian. Советская тяжеловозная порода лошадей – уникальное достижение отечественных селекционеров. Цель исследования – провести мониторинг генетической структуры советской тяжеловозной породы лошадей по микросателлитным локусам ДНК, определить генетическое разнообразие в популяции, исследовать генетические особенности линий в породе с использованием микросателлитных маркеров. Объектом исследования являлись чистопородные лошади советской тяжеловозной породы с подтверждённым происхождением, материалом – ДНК сертификаты с результатами генотипирования образцов проб волоса лошадей по 17 микросателлитным локусам. При проведении генетико-популяционного анализа рассчитывали следующие показатели: общее число аллелей на локус (Na), частота встречаемости аллелей, уровень полиморфности (Ae), степень наблюдаемой (Ho) и ожидаемой (He) гетерозиготности. Коэффициенты внутрипопуляционного инбридинга (Fis), коэффициент фиксации (Fst), коэффициент инбридинга особей в популяции (Fit) оценивали с применением методов F-статистики и использованием программного обеспечения Microsoft Exсel 2010. Научная новизна исследования заключается в изучении генетических особенностей и внутрилинейной дифференциации, наличии внутренних ресурсов для успешного развития советской тяжеловозной породы без привлечения постороннего генетического потенциала. При тестировании лошадей советской тяжеловозной породы по 17 микросателлитным локусам ДНК определили 118 аллелей, из которых наиболее часто встречаются аллели: HTG4M (0,449), VHL20O (0,378), HMS6L (0,545), HTG10M (0,391), HTG7M (0,132), HMS2H (0,564). Выявлены редкие аллели: ANT4 M(0,002), HMS7Q (0,002), HTG6R(0,002), HMS3O (0,002). Результаты исследований позволяют заключить, что практически во всех линиях советской тяжеловозной породы отсутствует внутрипопуляционный инбридинг, а применяемые методы разведения способствуют поддержанию генетического разнообразия в популяции.