Characteristics of one of the subpopulations of Kazakh white-headed cattle by microsatellite loci | Характеристика одной из субпопуляций скота казахской белоголовой породы по микросателлитным локусам

English. A genetic and population analysis of the polymorphism features of microsatellite markers in one of the subpopulations of Kazakh white-headed cattle by STR loci included in the standard control panel for the origin of cattle, was carried out. The genetic diversity and genetic structures of the breeding stock ("Cows-sample") and the sire group ("Bulls-sample") were evaluated using GenAlEx software in version 6.5. Breeding stock is presented by cattle of the Russian breeding, sires are mainly Kazakh bulls and their descendants. As a result of genotyping, alleles in fifteen loci recommended for DNA examinations of the authenticity of the origin of breeding stock were identified, total number of them was determined, and the number of effective alleles was established, the actual and expected degrees of heterozygosity were estimated. The Shannon information index and Wright fixation indices reflecting the genetic polymorphism of microsatellites are calculated. The determination of the digital values of genetic constants gave an assessment of the genetic structure of the breeding stock and producers. The high level of polymorphism and the codominant nature of inheritance of the studied loci made it possible to assess the genetic condition of the herd at the molecular level, the diversity degree of polymorphic genes and to give an objective assessment of the genetic variability level.

Russian. Проведен генетико-популяционный анализ особенностей полиморфизма микросателлитных маркеров одной из субпопуляций скота казахской белоголовой породы по STR-локусам, входящих в стандартную панель контроля происхождения крупного рогатого скота. Оценено генетическое разнообразие и генетическая структура маточного стада ("Cows-выборка") и группы производителей ("Bulls-выборка") с использованием программного обеспечения GenAlEx в версии 6.5. Маточное стадо представлено животными российской селекции, производители – преимущественно животными казахстанской селекции и их потомками. В результате генотипирования идентифицированы аллели в пятнадцати локусах, определено общее их количество и число эффективных аллелей, оценена фактическая, и ожидаемая степени гетерозиготности по обоим выборкам. Рассчитаны информационный индекс Шеннона и индексы фиксации Райта отражающие генетический полиморфизм микросателлитов. Определение цифровых значений генетических констант, дало оценку генетической структуры маточного поголовья и производителей. Высокий уровень полиморфизма и кодоминантный характер наследования изученных локусов, позволили на молекулярном уровне оценить генетическое состояние стада, степень разнообразия полиморфных генов и дать объективную оценку уровня генетической изменчивости.