Analysis of polymorphism of DNA microsatellite loci of false flax Camelina sativa | Анализ полиморфизма микросателлитных локусов ДНК рыжика посевного Camelina sativa

English. False flax (Camelina sativa (L.) Crantz) is a dicotyledonous plant of the Brassicaceae family, native to southern Europe and south-west Asia. False flax requires less water and fertilizers and, unlike other crops, is resistant to pests and pathogens. False flax seed oil contains unsaturated fatty acids: linolenic, linoleic, oleic and eicosenoic acids, with a low content of erucic acid. It is used in the production of fodder, biodiesel, polymers, varnishes, paint oil and paints, in cosmetology and the food industry. For effective development of new varieties of false flax, it is necessary to study its genetic diversity using molecular and genetic methods, including SSR-markers. Microsatellites are widely used in plant genome analysis. The aim of this work was to study the genetic diversity of winter and spring forms of false flax bred at the V.S. Pustovoit All-Russian Research Institute of Oil Crops (VNIIMK) using new experimental SSR-markers. We studied 18 winter and spring varieties of winter and spring false flax from the VNIIMK collection and two samples of the 'Krepysh' variety. Genetic diversity was studied using nine SSR-markers. PCR products were detected by capillary electrophoresis on a Nanofor-05 genetic analyzer. As a result, 42 alleles were detected, ranging from two to seven alleles per locus. The average effective number of alleles was 3.00. The average polymorphic information content (PIC) index was 0.66. Out of 20 genotypes, eight genotypes could not be distinguished by nine SSR-markers. To identify them, the number of SSR loci should be increased. 'Krepysh' samples differ in seven loci. The study showed genetic heterogeneity of four false flax varieties. The study of intravarietal polymorphism in the false flax varieties bred at VNIIMK will be continued.

Russian. Рыжик (Camelina sativa (L.) Crantz) – это двудольное масличное растение семейства Brassicaceae, родом из Южной Европы и Юго-Западной Азии. Рыжик требует меньше воды и удобрений и устойчив к вредителям и патогенам в отличие от других культур. Масло рыжика содержит ненасыщенные жирные кислоты: линоленовую, линолевую, олеиновую и эйкозеновую, имеет низкий уровень эруковой кислоты. Оно применяется в кормопроизводстве, производстве биодизеля, полимеров, лаков, олифы и красок, косметологии и пищевой промышленности. Для эффективного создания новых сортов рыжика необходимо изучать его генетическое разнообразие с помощью молекулярно-генетических методов, включая SSR-маркеры. Микросателлиты широко используются в анализе генома растений. Цель работы - изучение генетического разнообразия озимой и яровой форм рыжика селекции ВНИИМК с использованием новых экспериментальных SSR-маркеров. В работе изучали 18 сортообразцов рыжика посевного озимой и яровой форм из коллекции ВНИИМК и два образца сорта Крепыш. Генетическое разнообразие исследовали с помощью девяти SSR-маркеров. Продукты ПЦР детектировали методом капиллярного электрофореза на генетическом анализаторе Нанофор-05. В результате было выявлено 42 аллеля, от 2 до 7 на локус. Среднее эффективное число аллелей – 3,00. Среднее значение индекса полиморфного информационного содержания (PIC) – 0,66. Из 20 генотипов восемь не удалось отличить по девяти SSR-маркерам. Для их идентификации необходимо увеличить количество SSR-локусов. Образцы сорта Крепыш отличаются по семи локусам. Исследование показало генетическую неоднородность четырех сортов рыжика. Изучение внутрисортового полиморфизма у сортов рыжика посевного селекции ВНИИМК будет продолжено.