Biological diversity of micromycetes in agrocenoses of Western Siberia with the use of microbial preparations | Биологическое разнообразие микромицетов в агроценозах Западной Сибири при применении микробных препаратов

English. The studies were conducted in 2022-2024 to investigate the effect of presowing seed bacterization (PSB) on the taxonomic diversity of the fungal component of the rhizosphere microbiome of cereal crops. PSB was carried out using a preparation of diazotrophic bacteria Arthrobacter mysorens 7 and an inoculant of bacteria with fungicidal-stimulating action Flavobacterium sp. L-30. The experimental design is as follows: factor A – crop: 'Tarskaya 12' spring soft wheat, 'Siberian Hercules' oat ; factor B - bacterial preparation for seed inoculation: no preparation, Mizorin, Flavobacterin. For the first time, the taxonomic composition of the fungal community was determined based on the analysis of amplicon libraries of fragments of ribosomal operons of ITS2 fungi during colonisation of the roots of agricultural crops by nitrogen-fixing bacteria in various soil-climatic zones of the Omsk Irtysh region (southern forest-steppe and subtaiga). Sampling of the plant rhizosphere for metagenomic analysis was carried out in the heading phase (July). In the rhizosphere eukaryotic community, according to molecular genetic studies, 5 dominant phyla of soil fungi were determined: Ascomycota (about 70%), Mortierellomycota (about 7%), Basidiomycota (about 5%), Mucoromycota (3%), Chytridiomycota (1%). Among the orders, the representatives of Hypocreales (21.8%), Pleosporales (11.4%), Sordariales (11%), Mortierellales (6.7%), and Capnodiales (3.9%) dominated. A positive effect of associative nitrogen fixation biopreparations on the fungal community of the soil (rhizosphere) of the experimental plots was established. During PSB, the growth of saprotrophic fungi (Hypocreales, Sordariales, Mortierellales, Thelebolales, etc.) was observed in relation to the control variants. The fungicidal properties of the bacterial strains introduced into the soil were manifested in relation to phytopathogenic fungi of the orders Pleosporales (abundance in the wheat rhizosphere in the variant with Mizorin – 8.0%, with Flavobacterin – 9.6%, against 19.8% in the control), Erysiphales (abundance in the wheat rhizosphere in the variant with Flavobacterin 0.1%, against 2.8% in the control), etc.

Russian. Исследования проводили в 2022–2024 гг. с целью изучения воздействия предпосевной бактеризации семян (ПБС) на таксономическое разнообразие грибной компоненты микробиома ризосферы зерновых культур. ПБС осуществляли препаратом диазотрофных бактерий Arthrobacter mysorens 7 и инокулянтом бактерий фунгицидно-стимулирующего действия Flavobacterium sp. L-30. Схема опыта: культура – яровая мягкая пшеница Тарская 12, овёс Сибирский геркулес (фактор А); бактериальный препарат для инокуляции семян (фактор В) – без препарата, Мизорин, Флавобактерин. Впервые определен таксономический состав грибного сообщества, на основании анализа ампликонных библиотек фрагментов рибосомальных оперонов грибов ITS2, при колонизации корней с.-х. культур бактериями-азотфиксаторами в различных почвенно-климатических зонах Омского Прииртышья (южная лесостепь и подтайга). Пробы ризосферы растений для метагеномного анализа брали в фазе колошения (июль). В ризосферном эукариотном сообществе, по данным молекулярно-генетических исследований, определено 5 доминирующих филумов почвенных грибов: Ascomycota (около 70%), Mortierellomycota (около 7%), Basidiomycota (около 5%), Mucoromycota (3%), Chytridiomycota (1%). Среди порядков доминировали представители Hypocreales (21,8%), Pleosporales (11,4%), Sordariales (11%), Mortierellales (6,7%), Capnodiales (3,9%). Установлено положительное воздействие биопрепаратов ассоциативной азотфиксации на грибное сообщество ризосферы опытных участков. При ПБС отмечен рост грибов сапротрофных порядков (Hypocreales, Sordariales, Mortierellales, Thelebolales и др.) относительно контроля. Фунгицидные свойства интродуцированных в почву штаммов бактерий проявлялись относительно фитопатогенных грибов порядков Pleosporales (обилие в ризосфере пшеницы в варианте с Мизорином – 8,0%, с Флавобактерином – 9,6%, против 19,8% в контроле), Erysiphales (обилие в ризосфере пшеницы в варианте с Флавобактерином 0,1%, против 2,8% в контроле) и др.