Assessment of morphophysiological and genotypic diversity of endophytic bacteria isolated from rice (Oryza sativa L.) plants | Avaliação da diversidade morfofisiológica e genotípica de bactérias endofíticas isoladas de arroz (Oryza sativa L.)

English. Rice production in Brazil incurs high costs due to the significant use of agrochemicals. Some plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) can be used as alternative to fertilizers and phytosanitary products. Thus, the objective of this study was to characterize endophytic bacteria isolated from roots of rice plants. The isolates were characterized based on colony morphology, antibiotic resistance, carbon sources utilization, enzyme activity (catalase, amylase, protease, cellulase, and lipase), inorganic phosphate solubilization, and the 16S-23S rDNA intergenic region. Morphologically, 68% of the isolates presented a rapid growth rate, 46% presented abundant mucus production, and 77% formed viscous colonies. All isolates were resistant to nalidixic acid and 16% presented resistance to streptomycin. The majority (90%) used monosaccharides and disaccharides in carbon source assays. Most of the isolates (95%) were positive for catalase and 63.6% were positive for amylase, protease, lipase, and cellulase activities. Additionally, 59% of them were able to solubilize phosphate. The mean enzymatic index for amylase, cellulase, and protease was 2.8, 3.5, and 1.7 respectively. The similarity analysis revealed high diversity among the isolates, with similarity indices of 70% (based on morphological characteristics) and 60% (based on the intergenic region 16S-23S rDNA). Considering morphophysiological and genotypic characteristics, three promising isolates should be evaluated in studies under field conditions for the potential development of bioproducts to replace industrially manufactured inputs in rice crops.

Portuguese. O arroz apresenta altos custos de produção no Brasil devido ao elevado uso de agroquímicos. Algumas rizobactérias promotoras de crescimento de plantas (PGPR) podem ser utilizadas como alternativa aos fertilizantes e produtos fitossanitários. Este trabalho teve como objetivo caracterizar bactérias endofíticas obtidas de raízes de arroz. A caracterização dos isolados foi baseada na morfologia da colônia, resistência a antibióticos, uso de fontes de carbono, atividade enzimática (catalase, amilase, protease, celulase e lipase), solubilização de fosfato inorgânico e região intergênica do 16S-23S rDNA. Com base na morfologia, 68% dos isolados apresentaram crescimento rápido, 46% apresentaram produção abundante de muco e 77% apresentaram colônia viscosa. Todos os isolados foram resistentes ao ácido nalidíxico e 16% deles à estreptomicina. A maioria dos isolados (90%) utilizou monossacarídeos e dissacarídeos no ensaio da fonte de carbono. A maioria dos isolados (95%) foi positiva para catalase e 63,6% foram positivas para amilase, protease, lipase e celulase. Além disso, 59% foram capazes de solubilizar o fosfato. A média do índice enzimático para amilase, celulase e protease foi de 2,8, 3,5 e 1,7, respectivamente. A análise de similaridade revelou alta diversidade entre os isolados, com índice de similaridade de 70% (baseado nas características morfológicas) e 60% (baseado na análise da região intergênica 16S-23S rDNA). Com base nas características morfofisiológicas e genotípicas, três isolados promissores devem ser avaliados em estudos futuros em condições de campo, podendo gerar bioprodutos destinados a substituir insumos industrializados na cultura do arroz.