Toxoplasma gondii, Cryptosporidium and Giardia duodenalis : detection, identification and control strategies | Toxoplasma gondii, Cryptosporidium et Giardia duodenalis : détection, identification et stratégies de lutte

English. Toxoplasmosis, cryptosporidiosis and giardiasis are cosmopolitan zoonoses of major importance due to their impact on public and animal health and their economic and societal impact. The protozoa Toxoplasma gondii, Cryptosporidium and Giardia duodenalis responsible for these infectious diseases are present in foodstuffs and the environment. In 2012, experts from the Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO) and the World Health Organization (WHO) ranked them among the 24 most important foodborne parasites to be monitored. Developing high-performance screening, diagnostic, monitoring and integrated pest management tools for these zoonotic agents is therefore essential to better understand the "host-parasite" / "host-microbiota-parasite" interactions and the transmission mechanisms of these agents.The research work presented in this thesis has contributed to the monitoring of toxoplasmosis in sheep by assessing the distribution of T. gondii DNA in various organs of lambs. For the protozoa Cryptosporidium and Giardia duodenalis, they have enabled the development of an experimental in vivo neonatal mice model used for therapeutic screening, the characterization of Cryptosporidium and Giardia duodenalis isolates circulating in sheep farms in Algeria and Cryptosporidium isolates circulating in European hedgehogs (Erinaceus europaeus) in the Paris region and, finally, to set up innovative targeted therapeutic and/or prophylactic tools (use of probiotics to fight against giardiasis) and detection method (development of DNA aptamers) of these enteropathogenic agents.These research projects, which combine the protection of animal health with the protection of public health, in relation to their environment, are part of a “One Health” approach.

French. La toxoplasmose, la cryptosporidiose et la giardiose sont des zoonoses cosmopolites d’importance majeure, de par leur impact en santé publique et en santé animale, et, leur impact économique et sociétal. Les protozoaires Toxoplasma gondii, Cryptosporidium et Giardia duodenalis responsables de ces maladies infectieuses sont présents dans les denrées alimentaires et l’environnement. Ils ont été classés en 2012 par les experts de l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO) et de l'Organisation mondiale de la Santé (OMS) parmi les 24 parasites à transmission alimentaire d’importance à surveiller. Développer des outils performants de dépistage, de diagnostic, de surveillance et de lutte intégrée vis-à-vis de ces agents de zoonoses est donc essentiel pour mieux comprendre les interactions « hôte-parasite » / « hôte-microbiote-parasite » et les mécanismes de la transmission de ces agents.Les travaux de recherche présentés dans cette thèse ont contribué à la surveillance de la toxoplasmose chez les ovins en évaluant la distribution de l’ADN de T. gondii dans différents organes d’agneaux. Ils ont permis, pour les protozoaires Cryptosporidium et Giardia duodenalis, de développer un modèle expérimental in vivo souriceau nouveau-né utilisé pour le criblage thérapeutique, de caractériser des isolats de Cryptosporidium et de Giardia duodenalis circulant dans les élevages ovins en Algérie et des isolats de Cryptosporidium circulant chez les hérissons d’Europe (Erinaceus europaeus) en région parisienne et, enfin, de mettre en place des outils thérapeutiques et/ou prophylactiques ciblés innovants (utilisation de probiotiques pour lutter contre la giardiose) et d’une méthode de détection (mise au point d’aptamères ADN) de ces agents entéropathogènes.Ces travaux de recherche, combinant à la fois, la protection de la santé animale et la protection de la santé publique, en lien avec leur environnement, s’inscrivent dans une approche « One Health, une seule santé ».