Genetic monitoring as a promising tool for investigating fish habitat connectivity | Quel potentiel des outils génétiques pour étudier le rétablissement de la connectivité des habitats piscicoles ?

English. With approximately 92000 obstacles to flow identified in France, restoring the connectivity of fish habitats is today one of the main challenges of public environmental policies. Although restoration priorities are clearly defined, the assessment methods for analyzing connectivity issues are not subject to any specific regulations. Different approaches can thus be adopted in order to assess the barriers to fish mobility present in a watershed. The purpose of this paper is to present the potential of molecular biology tools to address habitat fragmentation issues. Through the presentation of the foundations and principles of application of population genetics, we will see how genetic data can facilitate the understanding of connectivity mechanisms and allow the identification of blocking points on a dendritic network. We will present two case studies on brown trout, illustrating how genetic data can be used as a decision support and diagnostic tool in the implementation of connectivity restoration programs.

French. Avec environ 92 000 obstacles à l'écoulement répertoriés sur le territoire français, le rétablissement de la connectivité des habitats piscicoles figure aujourd'hui parmi les principaux enjeux des politiques publiques de l'environnement. Si les priorités de restauration sont clairement définies, les méthodes d'évaluation pour l'analyse des problématiques de connectivité ne font en revanche l'objet d'aucune règlementation particulière. Différentes approches peuvent ainsi être adoptées afin d'évaluer les barrières à la mobilité piscicole présentes sur un bassin versant. L'objet de cet article est de présenter le potentiel des outils de biologie moléculaire pour traiter des problématiques de fragmentation des habitats. A travers la présentation des fondements et principes d'application de la génétique des populations, nous verrons en quoi les données génétiques peuvent faciliter la compréhension des mécanismes de connectivité et permettre d'identifier les points de blocage sur un réseau dendritique. Nous présenterons deux études de cas portant sur la truite fario, illustrant comment les données génétiques peuvent être valorisées comme outil d'aide à la décision et de diagnostic dans le cadre de la mise en place de programmes de rétablissement de la connectivité.