Comparative evaluation of the efficiency of DNA extraction methods from different sunflower plant material using ready-made extraction kits | Сравнительная оценка эффективности способов выделения ДНК из разного растительного материала подсолнечника с применением готовых наборов для экстракции

English. The study aimed to evaluate the efficiency of DNA extraction from different types of sunflower plant material using several kits for automated DNA extraction and purification. Twelve individual plants of the VK 678 line were analysed. The experimental mate¬rial consisted of axial organs of the achene embryo, true green leaf, cotyledon leaves of etiolated seven-day and three-day seedlings. Each tissue type (weight 1.2-5.1 mg) was obtained from 12 individual plants. The MagnoPrime FITO and MagnoPrime GMO reagent kits adapted for use on the Auto-Pure 96 automatic station for nucleic acid extraction and purification were used for DNA extraction. The quantity and quality of the extracted DNA were determined spectrophotometrically. The extraction kit, the type of plant material, and the interaction of these two factors had a reliable effect on the concentration of nucleic acids at the 5% significance level. When using the MagnoPrime FITO kit, the concentration of the nucleic acid solution extracted from the axial organs of the achene embryo and true green leaf varied in the ranges of 59.67-142.66 ng/μl and 43.38-209.01 ng/μl, respectively. There was no contamination with proteins and phenols in these variants, the A260/A280 ratio was within the optimal values of 1.81-2.13 units. The use of the MagnoPrime GMO kit ensured a high concentration of nucleic acids in the solution isolated from the axial organs of the achene embryo (95.92-140.38 ng/ μl). These DNA samples were also not contaminated with proteins, the optical density ratio A260/A280 was 1.96-2.05. The best results in terms of speed, cost-effectiveness, concentration and purity of isolated DNA were achieved with extraction from the axial organs of the achene embryo using the MagnoPrime FITO kit.

Russian. Исследование проводили с целью оценки эффективности выделения ДНК из разных типов растительного материала подсолнечника несколькими наборами для автоматической экстракции и очистки ДНК. Анализировали 12 индивидуальных растений линии ВК 678. Материалом для эксперимента служили осевые органы зародыша семянки, настоящий зелёный лист, семядольные листья этиолированных 7-дневного и 3-дневного проростков. Каждый тип ткани (навеска 1,2...5,1 мг) получен от 12 отдельных растений. Для выделения ДНК применяли наборы реагентов "МагноПрайм ФИТО" и "МагноПрайм ГМО", приспособленные для использования на автоматической станции для экстракции и очистки нуклеиновых кислот Auto-Pure 96. Количество и качество выделенной ДНК определяли методом спектрофотометрии. Набор для экстракции, тип растительного материала и взаимодействие этих двух факторов оказывали достоверное влияние на концентрацию нуклеиновых кислот на 5%-ном уровне значимости. При использовании набора "МагноПрайм ФИТО" концентрация раствора нуклеиновых кислот, извлеченного из осевых органов зародыша семянки и настоящего зелёного листа, варьировала в диапазонах 59,67...142,66 нг/ мкл и 43,38...209,01 нг/мкл соответственно. Загрязнение белками и фенолами в этих вариантах отсутствовало, соотношение А260/А280 находилось в пределах оптимальных значений 1,81…2,13 ед. Применение набора "МагноПрайм ГМО" обеспечивало высокую концентрацию нуклеиновых кислот в растворе, выделенном из осевых органов зародыша семянки (95,92…140,38 нг/мкл). Эти образцы ДНК так же не были загрязнены белками, соотношение оптической плотности А260/А280 составляло 1,96…2,05. Наилучшие результаты по скорости, экономичности, концентрации и чистоте выделенной ДНК достигались при экстракция из осевых органов зародыша семянки с использованием набора "МагноПрайм ФИТО".