Genetic Polymorphism of MC5R Gene on Growth Rate of Indigenous Chicken (Praduhangdum) | ความผันแปรทางพันธุกรรมของยีน MC5R ต่ออัตรา การเจริญเติบโตในไก่พื้นเมือง (ประดู่หางดำ)

English. The melanocortin-5 receptor (MC5R) gene is a key factor in the regulation of exocrine gland function which controls gastric juice production and cooperates with enzyme from pancreas. In this study, the genetic polymorphisms of MC5R genes in 220 indigenous chickens (Praduhangdum) were identified. The associations of MC5R genes with growth Rate in indigenous chickens were studied. Three single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the chicken MC5R genes were found in 5’-flanking regions at the position of 78(A>G), 249(A>G), and 388(T>A). One position of SNPs was developed as the simple DNA marker for genotyping. The Hin6I Restriction enzyme was used to detect SNPs at the position of 249(A>G). The allele frequencies were 0.52 for A and 0.48 for G. The results indicated that the polymorphisms of MC5R markers associated with average daily gain. It showed that average daily gain in indigenous chickens with genotype GG was higher than that of AA (P<0.05).

Thai. ยีน Melanocortin-5 receptor (MC5R) มีบทบาทต่อการควบคุมการทำงานของต่อมมีท่อที่ควบคุมการสร้างน้ำย่อยและการทำงานร่วมกับเอนไซม์จากตับอ่อน การศึกษาครั้งนี้ต้องการค้นหาความผันแปรทางพันธุกรรมของยีน MC5R ในไก่พื้นเมืองสายพันธุ์ประดู่หางดำ จำนวน 220 ตัวและวิเคราะห์ความสัมพันธ์ของยีน MC5R กับอัตราการเจริญเติบโต ผลการศึกษาพบว่ายีน MC5R  ในไก่พื้นเมืองสายพันธุ์ประดู่หางดำมี single nucleotide polymorphism (SNPs) ในบริเวณ 5’ flanking region จำนวน 3 ตำแหน่ง คือ 78(A>G), 249(A>G) และ 388(T>A) จากความผันแปรทางพันธุกรรมของยีน MC5R ดังกล่าว SNPs จำนวน 1 ตำแหน่ง ถูกคัดเลือกมาพัฒนาเป็นเครื่องหมายโมเลกุลดีเอ็นเออย่างง่ายเพื่อตรวจสอบจีโนไทป์โดยใช้ enzyme ตัดจำเพาะ Hin6I ตรวจสอบความผันแปรของ SNPs  ที่ตำแหน่ง 249(A>G) พบว่ามีความถี่อัลลีล A และ G เท่ากับ 0.52 และ 0.48 ผลการศึกษาครั้งนี้บ่งชี้ว่าความผันแปรของเครื่องหมายโมเลกุล MC5R มีความสัมพันธ์กับอัตราการเจริญเติบโตเฉลี่ยต่อวัน โดยพบว่าไก่พื้นเมืองที่มีจีโนไทป์ GG มีอัตราการเจริญเติบโตเฉลี่ยต่อวันสูงกว่าไก่พื้นเมืองที่มีจีโนไทป์ AA อย่างมีนัยสำคัญ (P<0.05)