DETECTION OF IGFBP3 GENE POLYMORPHISM AND PHYLOGENETIC ANALYSIS IN KAZAKH FAT-TAILED COARSE-WOOL SHEEP BREED | ҚАЗАҚТЫҢ ҚҰЙРЫҚТЫ ҚЫЛШЫҚ ЖҮНДІ ҚОЙ ТҰҚЫМЫНДА IGFBP3 ГЕНІНІҢ ПОЛИМОРФИЗМІН АНЫҚТАУ ЖӘНЕ ФИЛОГЕНЕТИКАЛЫҚ ТАЛДАУ | ВЫЯВЛЕНИЕ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНА IGFBP3 И ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ КАЗАХСКОЙ КУРДЮЧНОЙ ГРУБОШЁРСТНОЙ ПОРОДЫ ОВЕЦ

English. This study aims to investigate the polymorphism of the IGFBP3 gene in the Kazakh coarse wool sheep breed. PCR-RFLP and Sanger sequencing methods were applied in the research. Genomic DNA was extracted from peripheral blood samples of 380 sheep, and its quality and concentration were determined by spectrophotometry and agarose gel electrophoresis. PCR and Hae III restriction enzyme treatment were used to identify the polymorphisms of the IGFBP3 gene, resulting in the identification of 6 potential polymorphisms. Sanger sequencing revealed a C>G substitution at position 335 and a missense mutation caused by the Ala>Gly amino acid substitution at position 111. Based on the obtained data, phylogenetic analysis of the Kazakh coarse wool sheep was performed with other sheep breeds available in the NCBI database. The phylogenetic tree consisted of two clusters. This study, utilizing IGFBP3 gene polymorphisms, contributes to improving breeding programs in sheep farming. The results of this study scientifically confirmed, for the first time, the presence of genetic markers potentially influencing productivity in the Kazakh fat-tailed coarse-wool sheep breed. The identified missense mutation in the IGFBP3 gene provides new opportunities for selecting economically valuable traits in breeding programs. Phylogenetic analysis of the obtained sequences revealed genetic diversity and relationships among sheep breeds. These findings are crucial for the effective utilization of genetic resources and the preservation of adaptive traits of local sheep populations. Verification of the results through comparison with international scientific databases ensures their reliability and high applied significance.

Kazakh. Бұл зерттеу қазақтың құйрықты қылшық жүнді қой тұқымында IGFBP3 генінің полиморфизмін зерттеуге бағытталған. Зерттеуде РФҰП және Сэнгер әдістері қолданылды. 380 қой үлгісінің перифериялық қандарынан ДНҚ алынып, оның сапасы мен концентрациясы спектрофотометрия және агарозды гельде электрофорез арқылы анықталды. IGFBP3 генінің полиморфизмдерін анықтау үшін ПТР және HaeIII рестриктаза ферментімен өңдеу жұмыстары жүргізілді, нәтижесінде 6 болжамды полиморфизм анықталды. Секвенирлеу нәтижесінде 335 позицияда C>G ауысуы және 111 Аla>Gly амин қышқылының ауысуынан туындаған миссенс мутациясы анықталды. Алынған мәліметтер негізінде қазақтың құйрықты қылшық жүнді қой тұқымының NCBI базасындағы басқа қой тұқымдарымен филогенетикалық талдау жасалды. Филогенетикалық ағаш екі кластерден құралды. Осы зерттеу IGFBP3 генінің полиморфизмін қолдана отырып, қой тұқымдарының селекциялық жұмыстарын жетілдіруге мүмкіндік береді. Бұл зерттеу нәтижелері қазақтың құйрықты қылшық жүнді қой тұқымында өнімділікке әсер етуі ықтимал генетикалық маркерлердің болуын алғаш рет ғылыми тұрғыда дәлелдеді. Алынған деректер генетикалық ресурстарды тиімді пайдалану және жергілікті қой тұқымдарының бейімделгіш қасиеттерін сақтау үшін маңызды.Зерттеу нәтижелері халықаралық ғылыми базаға салыстыру арқылы верификацияланғандықтан, алынған тұжырымдар сенімді әрі қолданбалы маңызы жоғары.

Russian. Данное исследование направлено на изучение полиморфизма гена IGFBP3 у казахской грубошерстной овцы. В исследовании использовались методы РСЦ и секвенирования Сэнгера. Из 380 образцов крови овец была выделена геномная ДНК, качество и концентрация которой были определены с помощью спектрофотометрии и горизонтального электрофореза в агарозном геле. Для определения полиморфизмов гена IGFBP3 проведены ПЦР и обработка рестриктазой Hae III, в результате чего был выявлен 6 предполагаемых полиморфизмов. В результате секвенирования была обнаружена замена C>G на 335 позиции и миссенс-мутация, вызванная заменой аминокислот 111 Ala>Gly. На основе полученных данных был проведен филогенетический анализ казахской грубошерстной овцы с другими овечими популяциями, доступными в базе данных NCBI. Филогенетическое дерево состояло из двух кластеров. Данное исследование, используя полиморфизмы гена IGFBP3, позволяет улучшить селекционные работы в овцеводстве. Результаты данного исследования впервые научно подтвердили наличие генетических маркеров, потенциально влияющих на продуктивность казахской курдючной грубошерстной породы овец. Обнаруженная миссенс-мутация в гене IGFBP3 открывает новые возможности для отбора экономически ценных признаков в селекционной практике. Филогенетический анализ полученных последовательностей позволил выявить генетическое разнообразие и родственные связи между породами. Полученные данные имеют важное значение для эффективного использования генетических ресурсов и сохранения адаптивных свойств местных овечьих пород. Верификация результатов путем сопоставления с международными научными базами подтверждает их надежность и высокую прикладную значимость.