Refine search
Results 1-3 of 3
Some Software’s Used in DNA Sequencing Based Haplotype Analysis Full text
2019
Emel Tüten Sevim | Kemal Karabağ
Determination of genetic resources and their diversity constitutes are the initial step of the breeding programs. Before starting to the selection of the desired properties, many molecular methods are used to determine the existing genetic potential and determine the genotypic values. Many molecular methods (RAPD, RFLP, AFLP, SSR and DNA sequencing etc.) based on PCR technology are used to identify populations, identify genes related to yield and resistance, and demonstrate phylogenetic relationships. Many software’s for the analysis of molecular datasets obtained from molecular methods have been developed and the field of bioinformatics was born. In this study, after DNA sequence analysis; it is aimed to give information about haplotype analysis by determining SNPs (Single Nucleotide Polymorphism's) in individuals of populations, calculation of the genetic distance among populations and within populations, and software and analysis used for phylogenetic tree drawing.
Show more [+] Less [-]Bazı Anadolu Yerli Sığır Irklarının MtDNA D-loop Dizi Analizi: Genetik Çeşitlilik ve Popülasyon Geçmişinin Değerlendirilmesi Full text
2023
Müge Doğan | Mehmet Nizamlıoğlu
Bazı Anadolu Yerli Sığır Irklarının MtDNA D-loop Dizi Analizi: Genetik Çeşitlilik ve Popülasyon Geçmişinin Değerlendirilmesi Full text
2023
Müge Doğan | Mehmet Nizamlıoğlu
Maternal kalıtımın moleküler göstergesi olan mitokondrial DNA, genomik DNA‘ya oranla daha hızlı evrimleşmesi, rekombinasyonun olmayışı ve türlerin coğrafi dağılımına göre farklılıklar göstermesi gibi özelliklerinden dolayı popülasyon genomiği, filogenetik ve filocoğrafik çalışmalarda sıklıkla tercih edilen belirteçlerden birisidir. Bu çalışmada Anadolu'da yetiştirilen bazı yerli sığır ırklarının, ırk içi ve ırklar arası genetik çeşitlilikleri ile filogenetik ilişkilerinin ortaya konulması amacıyla mitokondrial DNA D-Loop bölgesi dizi analizleri gerçekleştirildi. Öncelikle araştırmaya konu olan sığır ırklarının örnekleme çalışması tamamlandı. Standart Fenol/Kloroform Yöntemi kullanılarak DNA izolasyonu yapılan örneklerin mitokondrial DNA D-Loop bölgesinin yükseltgenmesi ise Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile yapıldı. DNA dizi analizi sonrası yerli sığır ırklarına ait veriler GenBANK’ tan alınan referans mitokondrial DNA dizileri ile birlikte hizalandı. Haplotip ve nükleotid çeşitlilikleri ile popülasyon içi ve popülasyonlar arası genetik ve filogenetik ilişkileri değerlendirildi. Elde edilen veriler ile Anadolu yerli sığır ırklarının, nükleotid ve haplotip çeşitliliği, haplotip sayıları ile popülasyon içi ve popülasyonlar arası varyasyonun oldukça yüksek olduğu belirlendi. Anadolu da yetiştirilen yerli sığır ırklarının filogenetik olarak Asya ve Avrupa sığır ırkları arasında yer aldığı sonucuna varıldı.
Show more [+] Less [-]The battle against rural poverty and other challenges of development: Empirical analysis of women empowerment programme of Justice, Development and Peace Movement (JDPM) in Osun State, Nigeria | La batalla en contra de la pobreza rural y otros retos de desarrollo: Análisis empírico del programa de justicia y empoderamiento femenino, movimiento de paz y desarrollo (JDPM) en el estado de Osun, Nigeria Full text
2016
Faborode, Helen | Alao, Titus Olugbenga
The vital role played by women in agriculture and non-farm activities for achieving food security and economic growth led to the recognition of women as a vital instrument by both government and non-governmental organizations in the ‘battle’ against rural poverty and other challenges of development process. Hence, this article analysed the women empowerment programme of Justice, Development and Peace Movement (JDPM) of Osogbo Catholic Diocese in Osun State with a view to enhancing its effectiveness. The impact of the programme on the beneficiaries was assessed on four randomly selected communities from each of the three administrative zones of Osogbo, Ila and Ilesa. Twenty-five percent of the participants were proportionately sampled from each community selected, making 104 respondents. Structured interview schedule was performed for each data collection from programme beneficiaries while seven key informants were interviewed among the workers of the Diocese. Descriptive statistics (frequency counts, mean, percentages and standard deviation) and Pearson correlation was used to make inferences. Some of the results revealed that members of all religions practiced in the area benefitted from the programme. Results also revealed that age (r= -0.514), group size (r= -0.448), years of schooling (r=0.407) were significantly related to achievement of programme objectives at 0.01 level of significance while number of community associations (r=0.201), size of enterprise (r=0.448), and income (r=0.205) had significant relationship at 0.05 level of significance. The study also revealed that the programme had made the beneficiaries self reliant through skill acquisition but faced with financial constraint to start or expand the businesses learnt. It was recommended that the beneficiaries should be linked with financial institutions or banks where they could access loan with ease. | El rol vital ejercido por la mujer en la agricultura y en actividades no agrícolas para el establecimiento de la seguridad alimentaria y el crecimiento económico, ha llevado al reconocimiento de la mujer como un instrumento vital tanto para el gobierno como para organizaciones no gubernamentales en la batalla en contra de la pobreza rural y otros retos de procesos de desarrollo. Por lo tanto, esta investigación analizó el programa de justicia y empoderamiento femenino, el movimiento de paz y desarrollo (JDPM) de la diócesis católica de Osogbo en el Estado de Osun, Nigeria con el fin de mejorar su eficacia. El impacto del programa sobre los beneficiarios fue evaluado en cuatro comunidades seleccionadas aleatoriamente de cada una de las tres zonas administrativas de Osogbo, Ila e Ilesa. El 25% de los participantes fueron proporcionalmente muestreados de cada una de las comunidades seleccionadas obteniendo 104 encuestados. La entrevista estructurada fue presentada para cada colecta de datos a partir del programa de beneficiarios, mientras que siete informantes clave eran entrevistados entre los trabajadores de la diócesis. La estadística descriptiva (frecuencia, promedio, porcentajes y desviación estándar), así como la correlación Pearson fueron utilizados para realizar inferencias. Algunos de estos resultados revelaron que los miembros de todas las regiones practicaban en el área beneficiada del programa. Los resultados también revelaron que la edad (r= -0.514), el tamaño del grupo (r= -0.448), los años de escolaridad (r=0.407) estaban significativamente relacionados con el establecimiento de los objetivos del programa con un nivel de significancia del 0.0, mientras que el número de asociaciones comunitarias (r=0.201), el tamaño de la empresa rural (r=0.448), y los ingresos (r=0.205) presentaron una relación significativa con un nivel del 0.05 de significancia. El estudio también reveló que el programa ha hecho independientes a los beneficiarios gracias a la adquisición de herramientas pero también al enfrentarse con restricciones financieras para iniciar o expandir su negocio. Se recomendó que los beneficiarios deberían estar vinculados con instituciones financieras o bancos donde podían acceder a préstamos con facilidad.
Show more [+] Less [-]The battle against rural poverty and other challenges of development: Empirical analysis of women empowerment programme of Justice, Development and Peace Movement (JDPM) in Osun State, Nigeria Full text
2016
Faborode, Helen(Obafemi Awolowo University Department of Agricultural Extension and Rural Development) | Olugbenga Alao, Titus(Osun State University Department of Agricultural Economics and Extension College of Agriculture)
The vital role played by women in agriculture and non-farm activities for achieving food security and economic growth led to the recognition of women as a vital instrument by both government and non-governmental organizations in the ‘battle’ against rural poverty and other challenges of development process. Hence, this article analysed the women empowerment programme of Justice, Development and Peace Movement (JDPM) of Osogbo Catholic Diocese in Osun State with a view to enhancing its effectiveness. The impact of the programme on the beneficiaries was assessed on four randomly selected communities from each of the three administrative zones of Osogbo, Ila and Ilesa. Twenty-five percent of the participants were proportionately sampled from each community selected, making 104 respondents. Structured interview schedule was performed for each data collection from programme beneficiaries while seven key informants were interviewed among the workers of the Diocese. Descriptive statistics (frequency counts, mean, percentages and standard deviation) and Pearson correlation was used to make inferences. Some of the results revealed that members of all religions practiced in the area benefitted from the programme. Results also revealed that age (r= -0.514), group size (r= -0.448), years of schooling (r=0.407) were significantly related to achievement of programme objectives at 0.01 level of significance while number of community associations (r=0.201), size of enterprise (r=0.448), and income (r=0.205) had significant relationship at 0.05 level of significance. The study also revealed that the programme had made the beneficiaries self reliant through skill acquisition but faced with financial constraint to start or expand the businesses learnt. It was recommended that the beneficiaries should be linked with financial institutions or banks where they could access loan with ease | El rol vital ejercido por la mujer en la agricultura y en actividades no agrícolas para el establecimiento de la seguridad alimentaria y el crecimiento económico, ha llevado al reconocimiento de la mujer como un instrumento vital tanto para el gobierno como para organizaciones no gubernamentales en la batalla en contra de la pobreza rural y otros retos de procesos de desarrollo. Por lo tanto, esta investigación analizó el programa de justicia y empoderamiento femenino, el movimiento de paz y desarrollo (JDPM) de la diócesis católica de Osogbo en el Estado de Osun, Nigeria con el fin de mejorar su eficacia. El impacto del programa sobre los beneficiarios fue evaluado en cuatro comunidades seleccionadas aleatoriamente de cada una de las tres zonas administrativas de Osogbo, Ila e Ilesa. El 25% de los participantes fueron proporcionalmente muestreados de cada una de las comunidades seleccionadas obteniendo 104 encuestados. La entrevista estructurada fue presentada para cada colecta de datos a partir del programa de beneficiarios, mientras que siete informantes clave eran entrevistados entre los trabajadores de la diócesis. La estadística descriptiva (frecuencia, promedio, porcentajes y desviación estándar), así como la correlación Pearson fueron utilizados para realizar inferencias. Algunos de estos resultados revelaron que los miembros de todas las regiones practicaban en el área beneficiada del programa. Los resultados también revelaron que la edad (r= -0.514), el tamaño del grupo (r= -0.448), los años de escolaridad (r=0.407) estaban significativamente relacionados con el establecimiento de los objetivos del programa con un nivel de significancia del 0.0, mientras que el número de asociaciones comunitarias (r=0.201), el tamaño de la empresa rural (r=0.448), y los ingresos (r=0.205) presentaron una relación significativa con un nivel del 0.05 de significancia. El estudio también reveló que el programa ha hecho independientes a los beneficiarios gracias a la adquisición de herramientas pero también al enfrentarse con restricciones financieras para iniciar o expandir su negocio. Se recomendó que los beneficiarios deberían estar vinculados con instituciones financieras o bancos donde podían acceder a préstamos con facilidad
Show more [+] Less [-]Bazı Anadolu Yerli Sığır Irklarının MtDNA D-loop Dizi Analizi: Genetik Çeşitlilik ve Popülasyon Geçmişinin Değerlendirilmesi Full text
2023
Müge Doğan | Mehmet Nizamlıoğlu
Maternal kalıtımın moleküler göstergesi olan mitokondrial DNA, genomik DNA‘ya oranla daha hızlı evrimleşmesi, rekombinasyonun olmayışı ve türlerin coğrafi dağılımına göre farklılıklar göstermesi gibi özelliklerinden dolayı popülasyon genomiği, filogenetik ve filocoğrafik çalışmalarda sıklıkla tercih edilen belirteçlerden birisidir. Bu çalışmada Anadolu'da yetiştirilen bazı yerli sığır ırklarının, ırk içi ve ırklar arası genetik çeşitlilikleri ile filogenetik ilişkilerinin ortaya konulması amacıyla mitokondrial DNA D-Loop bölgesi dizi analizleri gerçekleştirildi. Öncelikle araştırmaya konu olan sığır ırklarının örnekleme çalışması tamamlandı. Standart Fenol/Kloroform Yöntemi kullanılarak DNA izolasyonu yapılan örneklerin mitokondrial DNA D-Loop bölgesinin yükseltgenmesi ise Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile yapıldı. DNA dizi analizi sonrası yerli sığır ırklarına ait veriler GenBANK’ tan alınan referans mitokondrial DNA dizileri ile birlikte hizalandı. Haplotip ve nükleotid çeşitlilikleri ile popülasyon içi ve popülasyonlar arası genetik ve filogenetik ilişkileri değerlendirildi. Elde edilen veriler ile Anadolu yerli sığır ırklarının, nükleotid ve haplotip çeşitliliği, haplotip sayıları ile popülasyon içi ve popülasyonlar arası varyasyonun oldukça yüksek olduğu belirlendi. Anadolu da yetiştirilen yerli sığır ırklarının filogenetik olarak Asya ve Avrupa sığır ırkları arasında yer aldığı sonucuna varıldı.
Show more [+] Less [-]