The prevalence of Campylobacter jejuni in various sources in Kayseri, Turkey, and molecular analysis of isolated strains by PCR-RFLP | Kayseri'de (Türkiye) çeşitli kaynaklarda Campylobacter jejuni'nin prevalansı ve izole edilen suşların PCR-RFLP ile moleküler analizi

Inglés. The objective of this study was to isolate, identify, and genotype Campylobacter jejuni from various sources in the province of Kayseri, Turkey. A total of 6667 samples consisting of 5167 human fecal swabs, 600 dog rectal swabs, 600 cattle gallbladders, and 300 chicken carcasses were examined. The samples were plated onto mCCDA (cefoperazone charcoal desoxycholate agar) agar. In order to identify C. jejuni, phenotypic tests and PCR (polymerase chain reaction) were performed. C. jejuni was isolated in 1.43%, 43.50%, 31.16%, and 56% of the human, dog, cattle, and chicken samples, respectively. Among the 690 C. jejuni strains that were isolated during the study period, 200 C. jejuni strains (50 strains from each species) were randomly selected. The selected strains were typed by using PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism) fla-typing. DdeI and HinfI restriction enzymes were used for molecular typing. Following the DdeI enzyme application, the strains produced various numbers of bands between 4 and 7, with a total of 20 different band profiles. No similar band profiles were seen among the strains isolated from different sources. It was found that HinfI was not a more discriminative enzyme for fla-typing of C. jejuni isolates.

Turco. Bu çalışma Kayseri yöresinde çeşitli kaynaklardan Campylobacter jejuni'nin izolasyonu, identifikasyonu ve identifiye edilen suşların genetik olarak tiplendirilmesi amacıyla yapıldı. Çalışma kapsamında, 5167 insan dışkı svabı, 600 adet köpek rektal svabı, 600 adet sığır safra kesesi ve 300 adet (paket) tavuk eti olmak üzere toplam 6667 adet numune incelendi. Örnekler izolasyon amacıyla mCCDA (cefoperazone charcoal desoxycholate agar)'a ekildi. C. jejuni'nın identifikasyonunda fenotipik testler ve PCR (Polymerase Chain Reaction)'den yararlanıldı. İnsan, köpek, sığır ve tavuk örneklerinden sırasıyla % 1,43, % 43,50, % 31,16 ve % 56 oranlarında C. jejuni izole edildi. Çalışma periyodu boyunca izole edilen 690 adet C. jejuni suşu içerisinden 200 adet seçilerek PCR-RFLP, (Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism) fla-typing yöntemi ile tiplendirildi. Moleküler tiplendirme amacı ile DdeI ve HinfI restriksiyon enzimleri kullanıldı. DdeI enzimi ile muameleden sonra suşlar 4 ile 7 arasında band oluşturdu ve incelenen tüm suşlar 20 farklı band profili gösterdi. Farklı kaynaklardan izole edilen suşlar arasında benzer band profili veren suşlara rastlanmadı. Bu çalışmada HinfI enziminin suşların tiplendirilmesinde ayırıcı olmadığı belirlendi.