Detección y caracterización molecular del Virus X de la Papa (PVX) en regiones productoras de papa de Colombia

Español; castellano. El cultivo de papa (Solanum tuberosum L.) se ve afectado por diferentes virus que reducen su rendimiento y la calidad del tubérculo-semilla. Determinar la distribución y la variabilidad genética de dichos patógenos, es fundamental para los programas de manejo integrado y mejoramiento genético. En este trabajo se evaluó la presencia y la variabilidad molecular de aislados de PVX en cultivos de papa de los departamentos de Antioquia, Cundinamarca, Boyacá y Nariño (Colombia). La evaluación de presencia se realizó mediante pruebas de ELISA, mientras que el análisis de variabilidad incluyó la secuenciación de una región parcial de la cápsida viral en 14 aislamientos y de porciones de los genes codificantes para las proteínas RdRp y Tgb1 para dos aislamientos. Los resultados indicaron la presencia del PVX en los cuatro departamentos con un índice de detección promedio del 8 por ciento, siendo Nariño la región con mayores niveles de detección (15 por ciento). Los análisis moleculares indicaron que la mayoría de aislamientos Colombianos se asociaron con cepas de Eurasia (Grupo I), mientras que dos aislamientos de Nariño lo hicieron con el grupo de cepas Andinas y del Reino Unido (Grupo II). La información generada en este trabajo permitirá apoyar los programas de certificación de semilla y mejoramiento genético de papa en Colombia.

Inglés. The potato (Solanum tuberosum L.) crop is strongly affected by different viruses that reduce yield and the quality of seed tubers. Knowledge of distribution and genetic variability of these pathogens is essential to support integrated pest management and breeding programs. In this research, the presence and molecular variability of PVX in potato crops was evaluated from the Colombian provinces of Antioquia, Cundinamarca, Boyacá and Nariño. The detection of this virus was performed by ELISA, while the variability was analyzed by sequencing a part of the viral capsid in 14 isolates as well as portions of genes codifying for proteins RdRp and Tgb1 for two isolates. Results indicated the presence of PVX in the four provinces with an average detection of 8 percent; although, in Nariño, PVX presence reached 15 percent. Molecular analysis indicated that most PVX Colombian isolates were associated with strains from Eurasia (Group I), while two isolates from Nariño grouped with Andean and some United Kingdom's strains (Group II). The information generated in this work will support programs of seed potato certification and breeding in Colombia.