DETECÇÃO DE POLIMORFISMOS NO EXON14 DO GENE CAPN1 EM RAÇAS BOVINAS EUROPÉIAS, ZEBUÍNAS E SEUS MESTIÇOS

Inglés. The present study aimed to develop a simple protocol for the identification of variability in exon14 of calpain (CAPN1) in 727 DNA samples of european and zebu cattle breeds and their crossbreed (Bos taurus taurus x Bos taurus indicus), in order to detect new markers for meat tenderness. Sequencing analysis of part of samples genotyped by PCR-RFLP and PCR-SSCP techniques confirm the relationship of the genotypes AA, GA and GG with the SNP530 (G4558A) and reveal other polymorphism (C4554T), justifying the six electrophoretic migration patterns observed by SSCP technique. These results indicate that the PCR-RFLP technique was sensitive to detect the SNP530, although the SSCP analysis has been more efficient and lower cost, allowing to identify the two SNP simultaneously. The allele G, considered favorable for meat tenderness in European breeds, was the most frequent in all breeds investigated, except in the Simmental. The C4554T polymorphism was not observed in Europeans breeds, except in Aberdeen Angus, although the T allele has been detected in very low frequency (0.0164). In native breed Caracu, this allele was also not frequent (0.0268), being detected only three heterozygotes CT. The genotype TT was detected only in the Zebu breeds (Guzerá and Nelore) and their crossbreed, whose allele frequencies of T were 0.1300, 0.1127 and 0.1149, respectively. The results obtained suggest that the allele T is marker of Zebu, whose genotypes are being investigated in conjunction with shear force data to find possible relationship with meat tenderness zebu.

Español; castellano. O presente estudo objetivou desenvolver um protocolo simples para a identificação da variabilidade no exon 14 do gene calpaína (CAPN1) em 727 amostras de DNA de bovinos de raças européias, zebuínas e mestiços (Bos taurus taurus x Bos taurus indicus), visando detectar novos marcadores para maciez de carne. As análises de seqüenciamento de parte das amostras genotipadas pelas técnicas de PCR-RFLP e PCR-SSCP confirmam a relação dos genótipos AA, GA e GG com o SNP530 (G4558A) e revelam outro polimorfismo (C4554T), justificando os seis padrões de migração eletroforética observados pela técnica de SSCP. Estes resultados indicam que a técnica PCR-RFLP foi sensível para detectar o SNP530, embora a análise de SSCP tenha sido mais eficiente e com custo inferior, permitindo identificar os dois SNP simultaneamente. O alelo G, considerado favorável para maciez de carne em raças européias, foi o mais freqüente em todas as raças investigadas exceto na Simental. O polimorfismo C4554T não foi observado nas raças européias, exceto na Aberdeen Angus, embora o alelo T tenha sido detectado em freqüência muito baixa (0,0164). Na raça Caracu, este alelo também não foi freqüente (0,0268), sendo detectado apenas três heterozigotos CT. O genótipo TT foi detectado apenas nas raças zebuínas (Guzerá e Nelore) e seus cruzados, cujas freqüências do alelo T foram 0,1300, 0,1127 e 0,1149, respectivamente. Os resultados obtidos sugerem que o alelo T seja marcador de raças zebuínas, cujos genótipos estão sendo investigados em conjunto com dados força de cisalhamento visando encontrar possível relação com maciez de carne zebuína.