Genetic polymorphism of fifteen microsatellite loci in Brazilian (blue-egg Caipira) chickens

Portugués. O objetivo deste trabalho foi investigar a variabilidade genética de quinze loci de microssatélites em galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis. Foram coletadas amostras de sangue de 100 galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis provenientes de propriedades da região rural do município de Dois Lajeados, RS. Após extração do DNA foram utilizados marcadores para quinze loci de microssatélites: LEI0248, LEI0221, LEI0214, LEI0192, LEI0217, LEI0254, LEI0194, LEI0212, MCW0371, ADL0278, LEI0234, MCW0183, MCW0216, MCW0330 e MCW0081 que foram amplificados por meio da técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR). A análise estatística foi conduzida utilizando o programa ARLEQUIN ver 3.5 e CERVUS ver 3.0.3. Foram determinadas às frequências alélicas, genotípicas e estimativas de heterozigosidade esperada (HE) e observada (HO), desvios do Equilíbrio de Hardy-Weinberg e conteúdo de informação polimórfica (PIC) para cada locus de microssatélite. Os resultados demonstraram um total de 186 alelos (somando os alelos dos 15 loci), com os fragmentos variando entre 83 e 490 pares de base, com número médio de alelos de 12,4, HE de 0,76±0,14 e HO de 0,49±0,21 e PIC de 0,706. Conclui-se que os microssatélites utilizados são polimórficos e que podem, portanto, serem utilizados para investigações genéticas em galinhas. A população de galinhas caipiras de ovos azuis analisada apresenta grande variabilidade gênica, o que as torna uma importante fonte de recursos genéticos, e que poderão, assim, serem utilizadas em futuros programas de melhoramento genético animal.

Inglés. The purpose of this study was to investigate the genetic polymorphism of fifteen microsatellites loci in Brazilian (blue-egg Caipira) chickens. Samples were collected from 100 blue eggs of Caipira chickens from rural properties in the city of Dois Lajeados, RS. After DNA extraction, the fragments related to molecular markers LEI0248, LEI0221, LEI0214, LEI0192, LEI0217, LEI0254, LEI0194, LEI0212, MCW0371, ADL0278, LEI0234, MCW0183, MCW0216, MCW0330 and MCW0081 were obtained by polymerase chain reaction (PCR). The statistical analysis were carried out with the softwares ARLEQUIN 3.5 version and CERVUS 3.0.3 version. The allelic and genotypic frequencies, deviations from Hardy-Weinberg equilibrium, estimates of observed (HO) and expected (HE) heterozygosity and polymorphic information content (PIC) were obtained for each marker locus. A total of 186 alleles from 15 loci were obtained, with sizes ranging of 83 to 490 base pairs. The medium number of alleles was 12.4, the HE was 0.76±0.14 and HO was 0.49±0.21 and PIC was 0.706. The first conclusion is that the microsatellites used are polymorphic and can be used to genetic studies in chickens. The second is that the "Caipira" chicken (blue eggs) population investigated has a great genic variability, which makes than an important source of genetic resources for future animal breeding programs.