Genomic analysis by pulsed-field gel electrophoresis of Erwinia amylovora strains from the Mediterranean region including Italy [pome fruit trees - fire blight]

Inglés. Erwinia amylovora strains from the Mediterranean region, including Italy, and from eastern Europe were assayed for their PFGE patterns after an XbaI digestion of the genomic DNA. The strains from Eastern Europe and the Mediterranean region were placed into the same group (Pt2), although a strain from Bulgaria and two strains from Israel carried an RFLP-pattern which distinguished them from the other strains in that regions. Strains from Austria and Czechia belonged to the central European type (Pt1), whereas strains from Italy could be divided into three groups, i.e. with patterns observed before for strains from Northern France (Pt3), the Mediterranean region (Pt2) and Central Europe (Pt1). Grouping of E. amylovora strains from northeastern Italy to strains from Northern France was confirmed by PFGE analysis after SpeI digestions. With an increasing number of E. amylovora strains isolated in the Mediterranean region, their differentiation by PFGE could possibly give clues about the distribution of fire-blight in the surrounding European countries

Italiano. I profili PFGE di ceppi di Erwinia amylovora, isolati nella regione mediterranea comprendente l'Italia e l'Europa orientale, sono stati analizzati dopo digestione del DNA genomico con endonucleasi XbaI. Un ceppo di origine bulgara e due ceppi provenienti da Israele hanno evidenziato un profilo PFGE distinguibile da quello degli altri ceppi isolati nell'Europa orientale e nella regione mediterranea, collocati invece nello stesso gruppo (tipo Pt2). I ceppi di origine austriaca e ceca hanno mostrato un profilo centro europeo (Pt1), mentre i ceppi isolati in Italia sono stati suddivisi in tre gruppi, con profili analoghi a quelli attribuiti a ceppi isolati nella Francia settentrionale (Pt3), nella regione mediterranea (Pt2) e nell'Europa centrale (Pt1). L'analisi PFGE dei prodotti di digestione con SpeI ha confermato l'appartenenza allo stesso gruppo dei ceppi di E. amylovora isolati nell'Italia nord-orientale e nella Francia settentrionale. La differenziazione mediante PFGE di un maggior numero di ceppi di E. amylovora isolati nella regione mediterranea potrebbe verosimilmente fornire indicazioni sulla distribuzione del colpo di fuoco nei paesi europei limitrofi