Stability and recovery of maize DNA during food processing

Inglés. The identification and quantification of food ingredients based on DNA detection depends strictly on DNA stability during the food preparation treatments and on the efficiency of DNA recovery. Investigations on DNA stability carried out on polenta by real time PCR revealed that after 65 min of processing the amplifiable DNA decreased to 40% of the amount detectable before processing. Four commercial kits for DNA extraction were compared with the hexadecyltrimethyl ammonium bromide (CTAB)-based method for DNA extraction from different maize foodstuffs: flour, canned maize, corn chip snacks, cheese corn puff snacks, chocolate corn flakes and an infant formula having a maize flour ingredient. The methods were evaluated for recovered DNA quality and yield by agarose gel electrophoresis, PCR and real time PCR targeting of the maize zein gene. No detectable DNA could be extracted from the chocolate corn flakes, whereas highly degraded DNA was extracted from all the other materials tested, except flour, which yielded high quality DNA. Among the tested methods, CTAB, the Wizard method and Wizard Magnetic DNA Purification System kits gave the highest DNA yields. The overall data indicate that quantitative detection of ingredients in processed food products may not reflect the original amount of DNA, due to DNA degradation and low yield of DNA recovery

Italiano. L'identificazione e la quantificazione di ingredienti alimentari effettuata mediante analisi del DNA dipende in particolar modo dalla stabilita' del DNA durante i trattamenti per la preparazione dell'alimento e dall'efficienza della recovery del DNA estratto. Indagini sulla stabilita' del DNA condotte in polenta mediante real time PCR rivelavano che dopo 65 min di cottura il DNA amplificabile diminuiva fino al 40% della quantita' presente prima della cottura. Quattro kit commerciali di estrazione di DNA sono stati confrontati con il metodo CTAB, basato sull'utilizzo dell'esadeciltrimetilammoniobromuro, su differenti alimenti derivati da mais: farina, mais in scatola, snack di mais, snack soffiati al formaggio, corn flakes al cioccolato e un omogeneizzato per bambini contenente mais come ingrediente. I metodi sono stati valutati per la qualita' e la recovery del DNA estratto mediante elettroforesi in gel di agarosio, PCR e real time PCR. La PCR aveva come bersaglio il gene della zeina. Da corn flakes al cioccolato non era estratto DNA, mentre da tutti gli altri alimenti saggiati veniva estratto DNA altamente degradato. Tra i metodi saggiati, CTAB, Wizard e il kit Wizard Magnetic DNA Purification System davano le recovery piu' elevate di DNA. I dati nel loro insieme indicano che l'analisi quantitativa di ingredienti in prodotti alimentari cotti puo' non riflettere la quantita' originariamente presente, per la degradazione del DNA e la bassa recovery