Construction of ASVs networks to monitor the temporal dynamics of bacterial communities - Application to public datasets on vegetable fermentations

Junker, Romane; Chuat, Victoria; Valence, Florence; Mistou, Michel-Yves; Aubert, Julie; Chaillou, Stéphane; Chiapello, Hélène; Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas]  ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement; Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf  ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement -Institut Agro Rennes Angers ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement -Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement; Mathématiques et Informatique Appliquées  ; AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement; MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé  ; AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement

Construction of ASVs networks to monitor the temporal dynamics of bacterial communities - Application to public datasets on vegetable fermentations

2022

Junker, Romane | Chuat, Victoria | Valence, Florence | Mistou, Michel-Yves | Aubert, Julie | Chaillou, Stéphane | Chiapello, Hélène | Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas] (MaIAGE) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (STLO) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | Mathématiques et Informatique Appliquées (MIA Paris-Saclay) ; AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS) ; AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)