Coancestry analysis of the germplasm used for breeding in Uruguay | Análisis de la coancestría en el germoplasma utilizado en el mejoramiento de cebada en Uruguay

Inglés. The study of the genetic diversity and the relationships existing within the available germplasm constitute an essential element in the decision-making process in a plant breeding program. The coefficient of coancestry (f),defined as the probability of two random alleles within two individuals being identical by descent, is the classic measure of genetic diversity. In this study, the coancestries of twenty-nine barley genotypes (varieties and experimental lines), representative of the germplasm used by breeders in Uruguay, were analyzed and the genotypes grouped according to their values. A second clustering procedure was carried based on the parentage relationship with a set of twenty-five ancestors of importance as sources of variability or quality, frequentlydetected in the studied pedigrees. The average coancestry ((f = 0.072 for the whole group; f = 0.080 when genotypes with incomplete pedigree were discarded) was intermediate when compared with reported values from different regions. The clustering based on these values showed a strong association with region of origin in the introduced genotypes, whereas the genotypes of national origin had a wider dispersion. The use of the coancestry with the set of ancestors detected different clusters, mainly explained by a limited number of ancestors with worldwide importance (Hanna, Haisa, Prior). The key factors in the conformation of the different groups were studied, as well as potential relationships with traits of interest.

Español; castellano. El estudio de la diversidad genética así como de las relaciones existentes entre el germoplasma en uso constituye un elemento esencial en el proceso de toma de decisiones dentro de un programa de mejoramiento. El coeficiente de coancestría (f), definido como la probabilidad de que dos alelos tomados al azar en dos individuos sean idénticos por descendencia, es la medida clásica de relación genética. En este trabajo se estudia la coancestría de 29 genotipos de cebada (líneas experimentales y variedades) representativos del germoplasma en uso en producción en Uruguay en los últimos 30 años, agrupándolas de acuerdo a este criterio. Como criterio adicional de agrupamiento se utilizó la coancestría que presentaron con respecto a 25 genotipos de importancia como fuentes de germoplasma o de calidad, que fueron detectados repetidamente en las genealogías estudiadas. La coancestría promedio calculada (f = 0,072 para el total; f = 0,080 eliminando los materiales sin pedigrí completo) fue intermedia si se la compara con los valores publicados a nivel mundial. El agrupamiento de materiales sobre la base de f mostró una clara asociación con la región de origen en los genotipos introducidos, mientras que los genotipos de origen nacional presentaron una mayor dispersión. La coancestría con ancestros de importancia como criterio de agrupamiento detectó diferentes asociaciones, explicadas en general por un reducido número de variedades ancestrales de gran importancia en el desarrollo del cultivo a nivel mundial (Hanna, Haisa, Prior). Las líneas claves en la conformación o separación de grupos fueron analizadas en cada caso, así como posibles asociaciones con parámetros de interés.